针对CD44的脂质纳米颗粒,用于增强CRISPR-Cas9在癌症基因编辑中的递送效果

《Journal of Contextual Behavioral Science》:CD44-targeted lipid nanoparticles for enhanced CRISPR-Cas9 delivery in cancer gene editing

【字体: 时间:2026年01月06日 来源:Journal of Contextual Behavioral Science 3

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  CRISPR/Cas9通过CD44靶向肽修饰的脂质纳米颗粒(LNPs)实现精准递送,有效抑制黑色素瘤体内外生长及脑转移模型中的肿瘤发展,为基因编辑治疗提供新策略。

  
作者:叶增、赵刚音、吴世迪、胡博川、加布里埃尔·福恩-库尼、伦佐·诺尔、阿卜杜勒瓦赫布·埃尔·加尔布祖里、埃娃·斯纳尔-雅加尔斯卡、亚历山大·克罗斯
荷兰莱顿大学莱顿化学研究所超分子与生物材料化学系,地址:Einsteinweg 55,2333 CC 莱顿

摘要

皮肤癌是第三大常见恶性肿瘤,其中黑色素瘤由于对现有疗法的抵抗性而最具挑战性。像CRISPR/Cas9这样的基因编辑技术为靶向癌基因提供了有前景的策略,但将这些工具高效地输送到肿瘤部位仍然是一个重大挑战。脂质纳米颗粒(LNPs)因其能够保护和运输大分子载荷而成为基因编辑工具的主要平台。为了提高黑色素瘤中的基因编辑精度,我们开发了具有CD44特异性的肽修饰LNPs,用于靶向输送CRISPR/Cas9 mRNA和针对polo样激酶1(sgPLK1)的引导RNA。我们的方法通过将CRISPR/Cas9和sgPLK1特异性地输送到黑色素瘤细胞中,显著增强了靶向性和基因编辑效果,在体外和体内皮肤黑色素瘤模型中均表现出显著的肿瘤生长抑制作用。此外,该平台还显示出能够到达脑部的转移性黑色素瘤,并在脑转移模型中显著抑制肿瘤生长。我们设想这种肽修饰策略可以进一步应用于提高基于CRISPR/Cas9的基因编辑的LNPs的靶向能力和治疗效果,为更精确和有效的癌症治疗铺平道路。

引言

黑色素瘤是最具侵袭性的皮肤癌类型之一,其遗传异质性导致预后不良和频繁复发[1]。尽管癌症治疗在控制肿瘤生长和延长患者生存方面取得了一些进展[2,3],但传统治疗方法往往受到脱靶效应和显著毒性的困扰,从而严重影响患者的生活质量[4,5,6]。这些挑战凸显了需要创新的治疗策略,以精确靶向驱动黑色素瘤的致癌基因,以改善临床结果和患者福祉。
斑马鱼模型被认为是黑色素瘤研究和药物评估中最合适的动物模型之一,因为它在关键癌症相关信号通路方面与人类高度保守[7,8,9]。大约70%的人类致癌基因在斑马鱼中有同源对应物,使得肿瘤发展的分子机制高度相似[10]。此外,斑马鱼对异种移植的人类黑色素瘤细胞具有很强的免疫耐受性[11],这有助于准确模拟肿瘤微环境和药物反应,对于评估抗肿瘤药物的效果非常有价值[7]。值得注意的是,斑马鱼的肿瘤异种移植模型为预测各种类型癌症的个性化治疗策略提供了平台[12,13]。当与黑色素瘤细胞和斑马鱼异种移植模型结合使用时,可以加速纳米药物的临床前开发,同时降低研发成本[14,15,16]。
近年来,基因编辑通过实现对驱动肿瘤生长和转移的致癌基因的精确修饰,彻底改变了癌症治疗方式,相比缺乏特异性的传统化疗具有优势[17,18,19]。在各种工具中,CRISPR/Cas系统因其能够选择性改变基因组、转录组和表观基因组而受到重视[20,21,22,23]。CRISPR/Cas9利用单导向RNA(sgRNA)引导的Cas9核酸酶诱导位点特异性的DNA双链断裂(DSBs),从而实现靶向基因破坏或校正[24,25]。然而,尽管其具有治疗潜力,但由于Cas9蛋白和sgRNA是大分子,需要高效且安全地输送到癌细胞中才能实现有效的基因编辑效果,因此临床应用受到限制。病毒载体已被探索用于输送CRISPR/Cas组分;然而,它们存在多种局限性,包括免疫原性、包装能力有限以及持续的Cas9表达,这增加了脱靶效应的风险[26,27]。非病毒输送系统,特别是脂质纳米颗粒(LNPs),作为一种有前景的替代方案,已在COVID-19大流行期间成功应用于mRNA疫苗的输送[28,29]。LNPs通常由四种关键成分组成:可电离脂质、胆固醇、辅助脂质和聚乙二醇化脂质[30,31]。这些结构具有高载荷封装效率、生物相容性和可扩展制造等优点。然而,LNPs的系统给药往往会导致其在非靶组织(尤其是肝脏)中的积累,限制了其对肿瘤部位的有效输送[32]。为了克服这些挑战,人们投入了大量努力来设计具有肿瘤靶向能力的LNPs[33,34]。使用靶向LNPs不仅解决了输送大分子基因编辑载荷的关键问题,还减少了脱靶效应,提供了更精确的治疗方法[35,36]。
一种有前景的方法是使用靶向配体,如肽,将其连接到LNPs表面以提高肿瘤特异性。肽作为靶向分子具有吸引力,因为它们分子量小、易于合成、稳定性高,并且对肿瘤细胞上过度表达的特定受体具有强亲和力[37,38]。这些特性使肽能够实现精确的肿瘤靶向,同时保持低毒性和高生物相容性,使其成为开发靶向药物输送系统的理想候选者[39,40,41]。CD44是一种参与细胞间相互作用、粘附和迁移的跨膜糖蛋白,在黑色素瘤中经常过度表达[1,42]。它通过促进上皮-间充质转化(EMT)、增强转移潜能和维持癌干细胞样表型来促进肿瘤进展[43,44]。由于在黑色素瘤细胞中的高表达,CD44成为治疗应用中的理想靶向分子[45,46,47]。值得注意的是,A6肽已被证明能有效结合过度表达CD44的肿瘤,包括黑色素瘤,为靶向输送提供了一个有前景的平台[45,48,49]。
在这项研究中,我们报道了开发了用于靶向输送CRISPR/Cas9组分到皮肤黑色素瘤细胞的肽修饰脂质纳米颗粒(LNPs)。具体来说,我们使用CD44靶向肽A6来功能化LNPs,以提高其对黑色素瘤的肿瘤特异性。这些功能化的LNPs装载了CRISPR/Cas9组分,包括Cas9 mRNA和针对polo样激酶1(PLK1)的单导向RNA(sgRNA),PLK1是细胞周期进展的关键调节因子和已知的致癌靶点[50,51]。通过将CD44靶向肽纳入LNP结构,我们在过度表达CD44的黑色素瘤细胞中实现了显著的细胞摄取和基因编辑效率提升。我们的体外和体内结果表明,PLK1表达受到显著抑制,从而有效抑制了黑色素瘤的生长并增强了抗肿瘤效果。这项工作突显了肽修饰LNPs作为高度特异性和有效的癌症治疗基因编辑输送平台的潜力。通过结合CRISPR/Cas9技术的精确性和肽修饰LNPs的靶向能力,我们提供了一种多功能策略,以提高基因治疗的效果和特异性。此外,这种输送系统在需要靶向基因组编辑方法的其他疾病治疗中也具有广泛的应用前景。

部分摘录

封装Cas9 mRNA和sgRNA的LNPs的开发和表征

脂质纳米颗粒(LNPs)已成为RNA治疗(包括siRNA和mRNA)的最先进输送平台,这从Onpattro制剂和两种COVID-19 mRNA疫苗的成功应用中得到了证明[52,53]。LNPs由四种关键脂质成分组成,每种成分在确保高效输送方面发挥着不同的作用。对于CRISPR-Cas9基因编辑,我们选择了可电离脂质MC3、ALC-0315、SM-102和OF-02进行进一步评估,因为它们已获得临床批准

结论

在这项研究中,我们利用修饰有CD44靶向肽的纳米颗粒将Cas9 mRNA和PLK1 sgRNA输送到黑色素瘤细胞中,从而实现PLK1的敲除,抑制肿瘤细胞生长,进而实现对黑色素瘤的治疗效果。为了全面评估我们的CD44靶向纳米颗粒输送系统的治疗效果,我们使用了一系列黑色素瘤模型,包括2D体外黑色素瘤细胞培养模型、3D肿瘤球体模型和全层黑色素瘤模型

CRediT作者贡献声明

叶增:撰写原始稿件、进行研究、进行正式分析、数据管理、概念构思。赵刚音:撰写原始稿件、进行研究、进行正式分析、数据管理、概念构思。吴世迪:数据管理。胡博川:进行研究、进行正式分析、数据管理。加布里埃尔·福恩-库尼:数据管理、进行正式分析、进行研究、撰写审查与编辑。伦佐·诺尔:进行研究、进行正式分析、数据管理。阿卜杜勒瓦赫布·埃尔·加尔布祖里:监督、进行研究。

利益冲突声明

作者声明没有利益冲突。

致谢

我们感谢莱顿大学医学中心(LUMC)细胞生物学系的Rob Hoeben教授和Martijn Rabelink提供慢病毒shRNA载体(Sigma-Aldrich)。赵刚音衷心感谢中国国家留学基金委员会(CSC)的支持。
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