Nocardiopsis moroccensis sp. nov. 的基因组测序与比较分析：这是一种来自摩洛哥高盐生态系统的耐盐放线菌

《BMC Microbiology》：Genome sequencing and comparative analysis of Nocardiopsis moroccensis sp. nov., a halotolerant Actinomycetota from Moroccan hypersaline ecosystem

　　

摘要

盐生和干旱生态系统被认为是具有独特适应能力和次级代谢潜力的新型放线菌的重要储库。在本研究中，从摩洛哥齐马湖（Lake Zima）的高盐湿地盐土中分离出一种耐盐放线菌菌株，命名为ZS3416R2A。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析显示，该菌株与Nocardiopsis terrae DSM 45157^T的相似度为99.03%，表明其与Nocardiopsis属有密切亲缘关系。全基因组测序结果显示，该菌株拥有一个6.1 Mb的环状染色体，G+C含量为70.48%，包含5,855个编码序列。基于基因组的指标（ANI 95.07%，dDDH 66.4%）支持将其归类为与N. terrae不同的新物种，而AAI（95.87%）和POCP（82.4%）则证实了其属于Nocardiopsis属。比较分析揭示了ZS3416R2A菌株中独特的基因家族、生物合成基因簇以及基因组可塑性区域。在表型特征上，ZS3416R2A菌株能够在广泛的盐度（0–10%）、温度（16–37°C）和pH值（7.0–8.0）范围内生长，并且形成的气生菌丝比DSM 45157^T菌株更密集，这反映了其对齐马湖干旱盐生环境的适应能力。化学分类学分析表明，MK-10(H₆)、MK-10(H₄)和MK-9(H₄)是主要的麦角醌类化合物，iso-C_16:0和10-甲基-C_18:0是主要脂肪酸，而二磷脂酰甘油、磷脂酰胆碱、磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺和磷脂酰肌醇是主要的极性脂质。基于这些多方面的证据，ZS3416R2A菌株代表了一个新的Nocardiopsis属物种，建议将其命名为Nocardiopsis moroccensis sp. nov.。模式菌株为ZS3416R2A^T（= CCMM B1332^T = DSM 120542^T）。