综述:21世纪用于评估植物多样性的基因组工具:从基于PCR的标记到高通量测序和环境DNA(eDNA)
马里奥·A·帕尼奥塔(Mario A. Pagnotta)
《Diversity》:Genomic Tools for Assessing Plant Diversity in the 2020s: From PCR-Based Markers to High-Throughput Sequencing and eDNA
Mario A. Pagnotta
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时间:2026年04月02日
来源:Diversity 2.1
摘要
对植物多样性的全面了解对于生态研究、保护规划和可持续资源管理至关重要。遗传技术的进步极大地改变了植物生物多样性的评估方式,使得对遗传变异的描述更加精确和高效。21世纪00年代末广泛使用的早期分子标记,已被基于聚合酶链反应(PCR)的工具所取代,这些新工具所需的DNA量更少,使用更加便捷,并且有易于获取的商业试剂盒支持。21世纪20年代,随着成本降低和效率提升,出现了更多新的、更易于使用的工具。高通量测序(HTS)技术通过提供全基因组的等位基因多样性、结构多态性和表观遗传修饰信息,进一步推动了该领域的发展。这些创新提高了适应性变异的检测能力,加深了对空间遗传结构的理解,并有助于评估环境对植物种群的影响。标记辅助选择技术在现代育种中已得到广泛应用,它利用基因组数据培育出具有更强抗性和理想农艺性状的品种。诸如环境DNA(eDNA)分析、高通量表型鉴定和先进生物信息学工作流程等新兴工具,增强了监测物种、评估种群生存能力以及识别与适应性相关的关键性状的能力。本文旨在总结这些技术进步,以及来自下一代测序(NGS)到基于测序的基因分型(genotyping-by-sequencing)的各种最新和实用工具,探讨它们在保护植物遗传资源、改进育种计划以及深入了解变化中的生态系统中的植物多样性方面的作用。
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