印度艾哈迈达巴德城市地区印楝（Azadirachta indica A. Juss.）的遗传多样性与种群结构评估

《Biochemical Genetics》：Assessment of Genetic Diversity and Population Structure on Azadirachta indica A. Juss. in an Urban Metropolitan: Ahmedabad, India

本研究首次深入探讨Ahmedabad市印度楝（Neem）的遗传多样性与种群结构。通过DNA条形码验证物种真实性，结合GIS采样和ISSR标记分析35份样本，发现高多态性（75.66%），遗传多样性指数低至中等（Hs=0.14，Ht=0.217，I=0.217）。AMOVA显示81%的变异源于种群内，Gst=0.319表明低遗传分化，Nm=1.06显示适度基因流。Mantel检验表明地理与遗传距离弱相关，STRUCTURE分析揭示两个亚种群（K=2）。结果表明城市化未显著破坏遗传连通性，凸显其适应都市环境的潜力，为育种、可持续发展及全球 conservation 提供关键依据。

　　

摘要

Azadirachta indica（A. indica）A. Juss.，通常被称为印楝，是一种具有广泛药用价值和社会经济重要性的多功能树木，自古阿育吠陀时代起就备受重视。尽管其重要性不言而喻，但人们对艾哈迈达巴德大都市区内该物种的遗传多样性了解甚少。本研究首次深入探讨了艾哈迈达巴德地区A. indica的遗传多样性和种群结构。通过DNA条形码技术验证了该物种的真实性，并利用地理信息系统（GIS）收集样本。共分析了35个A. indica样本，使用了五种简单序列重复区间（ISSR）引物。通过多态性评估、聚类、排序和贝叶斯种群结构分析等方法，研究了遗传多样性和种群结构。ISSR分析显示高度的多态性（75.66%），表明不同样本之间存在显著的遗传变异。遗传多样性指数分析结果显示多样性较低至中等（Hs = 0.14，Ht = 0.217，I = 0.217）。分子方差分析（AMOVA）表明81%的变异来自种群内部，19%来自种群间。较低至中等的遗传分化程度（Gst = 0.319）和适度的基因流（Nm = 1.06）表明城市发展并未阻碍种群间的基因流动。Mantel检验显示遗传距离与地理距离之间存在弱但显著的相关性，表明距离对物种隔离的影响有限。利用STRUCTURE软件估计的ΔK值表明存在两个亚种群，代表两个基因库（K = 2）。总体而言，这些结果表明城市化并未严重破坏A. indica的遗传连通性，体现了其在都市环境中的适应能力和恢复力。这些发现为进一步了解印度增长最快的城市之一——艾哈迈达巴德地区A. indica的遗传多样性和种群结构提供了关键信息，这些知识可应用于新的育种计划、可持续发展和全球范围内的保护策略。

图形摘要

Azadirachta indica（A. indica）A. Juss.，通常被称为印楝，是一种具有广泛药用价值和社会经济重要性的多功能树木，自古阿育吠陀时代起就备受重视。尽管其重要性不言而喻，但人们对艾哈迈达巴德大都市区内该物种的遗传多样性了解甚少。本研究首次深入探讨了艾哈迈达巴德地区A. indica的遗传多样性和种群结构。通过DNA条形码技术验证了该物种的真实性，并利用地理信息系统（GIS）收集样本。共分析了35个A. indica样本，使用了五种简单序列重复区间（ISSR）引物。通过多态性评估、聚类、排序和贝叶斯种群结构分析等方法，研究了遗传多样性和种群结构。ISSR分析显示高度的多态性（75.66%），表明不同样本之间存在显著的遗传变异。遗传多样性指数分析结果显示多样性较低至中等（Hs = 0.14，Ht = 0.217，I = 0.217）。分子方差分析（AMOVA）表明81%的变异来自种群内部，19%来自种群间。较低至中等的遗传分化程度（Gst = 0.319）和适度的基因流（Nm = 1.06）表明城市发展并未阻碍种群间的基因流动。Mantel检验显示遗传距离与地理距离之间存在弱但显著的相关性，表明距离对物种隔离的影响有限。利用STRUCTURE软件估计的ΔK值表明存在两个亚种群，代表两个基因库（K = 2）。总体而言，这些结果表明城市化并未严重破坏A. indica的遗传连通性，体现了其在都市环境中的适应能力和恢复力。这些发现为进一步了解印度增长最快的城市之一——艾哈迈达巴德地区A. indica的遗传多样性和种群结构提供了关键信息，这些知识可应用于新的育种计划、可持续发展和全球范围内的保护策略。

图形摘要