肉鸡11个不同解剖部位的骨骼肌转录谱分析

《Genomics》：Transcriptional profiles of skeletal muscles from 11 different anatomical locations in broiler chickens

　　

Fanli Kong|Xinyu Wu|Bo Zeng|Xu Qi|Zhengjiang Liu|Ruohan Yang|Lu Lu|Jiaxue Cao|Xiaolan Fan|Haohuan Li|Hua Li|Chengdong Wang|Desheng Li|Mingzhou Li

四川农业大学畜禽育种产业国家重点实验室，中国成都611130

摘要

鸡（Gallus gallus domesticus）是全球最常见的家养动物之一，其骨骼肌是高质量蛋白质的主要来源。骨骼肌的生长和发育直接决定了禽肉的质量和产量。尽管骨骼肌在不同解剖部位具有明显的功能特异性，但这种多样性的转录机制，尤其是在肌肉稳态维持的产后阶段，目前在肉鸡中仍大多未被研究。为了表征鸡骨骼肌的转录调控多样性，我们对11个解剖部位的55个骨骼肌样本进行了转录组分析，这些样本来自61周龄和80周龄的白羽肉鸡。研究结果表明，HOX基因家族的表达模式与解剖区域（头部、躯干、四肢）密切相关，证实了特定区域的发育调控；然而，不同骨骼肌中的全局PCG（pluripotent stem cell-related）基因表达谱几乎没有差异。MYH1E和MYH7B分别被确定为鸡快肌和慢肌的候选标记基因。MYH1E相关基因主要参与糖酵解途径，而MYH7B相关基因则参与氧化代谢。此外，TPM3、TNNT1、TNNI1、TNNC1、MYL3和MYL10可能作为鸡慢肌的潜在指标。总体而言，我们的研究结果为鸡骨骼肌提供了转录图谱，显著补充了目前对其在不同解剖部位和年龄阶段的分子多样性的认识，为禽类育种和肉类生产提供了关于肌肉特化及年龄相关调控的直接见解。