《Scientific Data》：Chromosome-level Genome Assembly and Annotation of the bighead beaked sandfish (Gonorynchus abbreviatus)
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针对大头喙沙鳕(Gonorynchus abbreviatus)基因组资源匮乏问题，研究者整合DNBSEQ、PacBio和Hi-C测序技术完成染色体级别(27条)高质量基因组组装(609.20?Mb，scaffold N50 22.33?Mb)，经BUSCO评估完整度达99.07%，鉴定22,396个蛋白编码基因(95.68%获功能注释)，为探讨该物种进化历史与遗传机制提供关键资源。
西北太平洋深水区栖息的大头喙沙鳕（Gonorynchus abbreviatus）作为典型的底栖鱼类，不仅是海洋生态系统的重要组成，更是探究鱼类适应性进化与早期脊椎动物演化关系的理想模型。然而，受限于深海采样难度与技术手段，该物种长期缺乏高质量的基因组资源，导致其遗传背景、关键适应性基因及分子调控机制难以被系统解析，严重制约了相关进化生物学与保护遗传学研究的深入开展。为此，科研团队在《Scientific Data》发表最新成果，成功构建首个染色体水平的基因组图谱，填补了该领域的资源空白。
研究团队综合利用DNBSEQ短读长、PacBio长读长测序数据结合Hi-C染色质构象捕获技术进行全基因组组装，基于大头喙沙鳕自然种群样本，通过序列校正、挂载与注释流程获得高精度参考基因组。
基因组组装与质量评估
最终获得总长度为609.20?Mb的基因组组装结果，scaffold N50达22.33?Mb，成功锚定至27条染色体，覆盖度与连续性显著优于先前碎片化数据。通过BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs）评估显示核心基因集完整度为99.07%，证实组装的高度完整性。
重复序列与结构特征
基因组中重复序列占比32.88%，其中DNA转座子（12.33%）为主要类型，该类元件的分布与活性对物种特异性基因家族扩张及染色质结构重塑具有潜在调控作用。
基因结构与功能注释
共预测22,396个蛋白质编码基因，其中21,429个（95.68%）获得功能注释，涵盖代谢、免疫、感官发育等关键通路，为挖掘深海环境适应相关候选基因奠定基础。
本研究完成了大头喙沙鳕染色体级别的高质量基因组组装与系统注释，解决了该物种基因组资源缺失的核心瓶颈。组装的连续性、准确性及功能注释覆盖率均达到前沿标准，不仅为阐明其深海适应性进化机制（如压力响应、感官特化）提供了分子基础，更可作为比较基因组学研究的关键节点，推动对早期辐鳍鱼类演化规律的理解。该资源兼具生态保护与进化研究价值，对海洋生物多样性保护策略制定具有重要支撑意义。
