对固定包埋（FFPE）组织进行tsRNA测序后，发现i-tRF-Gly-GCC可作为结直肠癌的生物标志物

《Genomics》：tsRNAs sequencing of FFPE tissues reveals i-tRF-Gly-GCC as a biomarker for colorectal cancer

　　

姚玉婷|刘安瑞|赖玉山|罗文峰|张晓英|林晓玲|塔希尔·阿里·汗|王晓云|万宇

华南师范大学-番禺中心医院转化医学研究联合实验室，广州医科大学附属番禺中心医院，中国广州

摘要

结直肠癌（CRC）仍然是全球范围内最为常见且致命的恶性肿瘤之一，因此需要可靠的生物标志物来进行检测。本研究分析了CRC组织中的tRNA衍生小RNA（tsRNA），发现了1051个差异表达的tsRNA。值得注意的是，i-tRF-Gly-GCC在CRC组织及患者血清中的水平显著高于对照组，ROC分析显示其AUC值大于0.7，这表明它具有潜在的诊断价值。加权基因共表达网络分析（WGCNA）显示，i-tRF-Gly-GCC的靶基因（包括在COAD和READ数据集中下调的RAC2）与CRC密切相关。基因本体论和KEGG通路分析进一步证实了i-tRF-Gly-GCC与癌症相关过程的关联。在HCT-116细胞中的功能性实验表明，i-tRF-Gly-GCC能促进细胞增殖和迁移。这些结果提示i-tRF-Gly-GCC可作为一种新型的非侵入性CRC检测生物标志物，并有可能成为治疗靶点，从而加深了我们对于tsRNA在CRC中调控作用的理解，为临床应用奠定了基础。