Zygotorulaspora florentina（以前称为
Zygosaccharomyces florentinus（
1）是一种子囊菌酵母，可从多种来源分离得到，包括葡萄汁、植物材料、果蝇以及以水果为原料的软饮料（
2）。由于它能够发酵麦芽糖和麦芽三糖，并且在与
Saccharomyces cerevisiae共发酵过程中能够提升香气复杂性，因此在酿造和葡萄酒制造领域的应用前景日益受到关注（
3–5）。本研究结合了短读长和长读长测序技术，对从英国诺里奇购买的一瓶诺福克产有机康普茶中分离出的
Z. florentina NCYC 4520菌株进行了基因组组装。将100 μL康普茶样本接种在Rose Bengal琼脂上，于25°C下培养2天后，挑选菌落并通过两轮在Yeast Malt（YM）琼脂（含有10 g/L葡萄糖、3 g/L麦芽提取物、5 g/L蛋白胨和3 g/L酵母提取物）上的划线培养进行纯化，再次在25°C下培养。利用ITS1和ITS4引物（
6,
7）通过ITS测序对该菌株进行鉴定（GenBank登录号：
PX480735）。通过与NCBI的rRNA_typestrains/ITS_RefSeq_Fungi数据库进行BLASTn比对（
8），发现其序列与
Z. florentina标准菌株（
KY106082）的同一性达到100%。
基因组DNA的提取使用的是Cambio公司的MasterPure酵母DNA纯化试剂盒，并添加了zymolyase和proteinase K处理步骤，样品来自在25°C下培养2天的液体YM培养物。短读长文库的制备采用了Illumina公司的Nextera DNA Flex文库制备试剂盒，使用20倍稀释的试剂，在Illumina NextSeq 500测序仪上进行测序，获得了1160万个150 bp的双端读取序列。Nanopore文库的制备则未进行片段化或大小筛选，使用的是Oxford Nanopore Technologies公司的SQK-LSK109 1D连接试剂盒（ONT），并在MinION仪器（ONT）上使用R9.4.1流动池进行测序，得到了336,776条读取序列，平均长度为15,734 bp。除非另有说明，所有软件均使用默认参数进行操作。碱基鉴定使用的是ONT公司的Guppy（v3.6.0）软件，并设置为高精度模式（model dna_r9.4.1_450bps_hac）。
Illumina测序数据使用fastp v.0.23.2（
9）进行过滤；Nanopore测序数据使用NanoFilt v.2.3.0（
10）进行过滤，筛选出质量≥10且长度≥5,000 bp的读取序列。读取序列的质量通过FastQC v.0.12.1（
11）进行验证。过滤后保留了161,449条Nanopore读取序列（平均长度为14,386 bp）。Nanopore读取序列的
de novo组装使用Flye v2.9.1（
12）完成，采用“ONT regular reads, pre-Guppy5”模式处理长读取序列。最终组装结果通过三轮使用BWA-MEM v.0.7.17.1（
13）的对齐和Pilon v.1.24（
14）的校正进行了优化。最终组装结果包含15个 contigs，其中8个为染色体大小的 contigs，其中5个 contigs在一端含有13 bp的端粒重复序列（5′-
TGTAGGGGTGTGG-3′）
n（
15），该序列通过Tandem Repeats Finder v.4.09（
16）鉴定得出。基因组总长度为11,137,782 bp，N
50为1,404,365 bp，G + C含量为41.03%。使用saccharomycete_odb10数据集通过BUSCO v.5.5.0（
17）估计基因组完整性为99.6%。Augustus v.3.2.3（
18）基于
Saccharomyces cerevisiae训练数据集预测了5,065个蛋白质编码基因，tRNAscan-SE 2.0（
19）检测到194个tRNA基因。
