耐逆性红球菌（Rhodococcus pyridinivorans）IEGM 639的基因组序列草图

《Microbiology Resource Announcements》：Draft genome sequence of stress-tolerant Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639

通过Illumina测序技术解析了石油雪中分离的耐溶剂、重金属及高盐菌株Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639的抗逆基因机制，鉴定出与烷烃氧化、金属转运及抗逆相关的关键蛋白。

　　

摘要

Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639的基因组是使用Illumina技术进行测序的。这种细菌具有耐溶剂、耐重金属和耐高盐度的特性，并能氧化多种有机化合物。所获得的序列可以用于揭示这些特性的遗传机制。

公告

耐逆境且对生长条件要求不高的微生物易于维护，适用于长期的生物技术过程和原位生物修复。Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639是从俄罗斯乌拉尔地区珀姆地区的油田积雪中分离出来的。积雪是在无菌条件下采集的。融化后，将100 μL的样本涂布在矿物琼脂K上，并在28°C下、存在正十六烷蒸汽的环境中培养。K培养基的组成（g·L^?1）为：KNO₃ – 1.0, KH₂PO₄ – 1.0, K₂HPO₄ – 1.0, NaCl – 1.0, MgSO₄ – 0.2, CaCl₂ – 0.02, FeCl₃ – 0.001, 琼脂 – 15.0；pH值为6.8–7.0。通过划线法获得了纯培养物。根据其形态特征和酶活性，该菌株最初被鉴定为Rhodococcus rhodochrous（NCBI分类号：1829）。该菌株能够氧化C₃–C₄和C₁₁–C₁₆正烷烃、硫茴香醚以及(–)-反式-香叶醇（数据未发表），并且表现出极强的耐逆境能力。它在80%正十六烷环境中仍能生长（数据未发表）；对5–40 mM的重金属具有抗性（数据未发表）；2–5%的NaCl可以促进该菌株对液态烃的吸附（数据未发表）。IEGM 639菌株已存入区域性的专性烷烃营养微生物菌库（缩写IEGM，WDCM编号768，网址：http://www.iegmcol.ru/strains/rhodoc/pyridin/r_pyridin639.html）。

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耐逆境且对生长条件要求不高的微生物易于维护，适用于长期的生物技术过程和原位生物修复。Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639是从俄罗斯乌拉尔地区珀姆地区的油田积雪中分离出来的。积雪是在无菌条件下采集的。融化后，将100 μL的样本涂布在矿物琼脂K上，并在28°C下、存在正十六烷蒸汽的环境中培养。K培养基的组成（g·L^?1）为：KNO₃ – 1.0, KH₂PO₄ – 1.0, K₂HPO₄ – 1.0, NaCl – 1.0, MgSO₄ – 0.2, CaCl₂ – 0.02, FeCl₃ – 0.001, 琼脂 – 15.0；pH值为6.8–7.0。通过划线法获得了纯培养物。根据其形态特征和酶活性，该菌株最初被鉴定为Rhodococcus rhodochrous（NCBI分类号：1829）。该菌株能够氧化C₃–C₄和C₁₁–C₁₆正烷烃、硫茴香醚以及(–)-反式-香叶醇（数据未发表），并且表现出极强的耐逆境能力。它在80%正十六烷环境中仍能生长（数据未发表）；对5–40 mM的重金属具有抗性（数据未发表）；2–5%的NaCl可以促进该菌株对液态烃的吸附（数据未发表）。IEGM 639菌株已存入区域性的专性烷烃营养微生物菌库（缩写IEGM，WDCM编号768，网址：http://www.iegmcol.ru/strains/rhodoc/pyridin/r_pyridin639.html）。

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Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639的基因组是使用Illumina技术进行测序的。这种细菌具有耐溶剂、耐重金属和耐高盐度的特性，并能氧化多种有机化合物。所获得的序列可以用于揭示这些特性的遗传机制。

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耐逆境且对生长条件要求不高的微生物易于维护，适用于长期的生物技术过程和原位生物修复。Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639是从俄罗斯乌拉尔地区珀姆地区的油田积雪中分离出来的。积雪是在无菌条件下采集的。融化后，将100 μL的样本涂布在矿物琼脂K上，并在28°C下、存在正十六烷蒸汽的环境中培养。K培养基的组成（g·L^?1）为：KNO₃ – 1.0, KH₂PO₄ – 1.0, K₂HPO₄ – 1.0, NaCl – 1.0, MgSO₄ – 0.2, CaCl₂ – 0.02, FeCl₃ – 0.001, 琼脂 – 15.0；pH值为6.8–7.0。通过划线法获得了纯培养物。根据其形态特征和酶活性，该菌株最初被鉴定为Rhodococcus rhodochrous（NCBI分类号：1829）。该菌株能够氧化C₃–C₄和C₁₁–C₁₆正烷烃、硫茴香醚以及(–)-反式-香叶醇（数据未发表），并且表现出极强的耐逆境能力。它在80%正十六烷环境中仍能生长（数据未发表）；对5–40 mM的重金属具有抗性（数据未发表）；2–5%的NaCl可以促进该菌株对液态烃的吸附（数据未发表）。IEGM 639菌株已存入区域性的专性烷烃营养微生物菌库（缩写IEGM，WDCM编号768，网址：http://www.iegmcol.ru/strains/rhodoc/pyridin/r_pyridin639.html）。

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耐逆境且对生长条件要求不高的微生物易于维护，适用于长期的生物技术过程和原位生物修复。Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639是从俄罗斯乌拉尔地区珀姆地区的油田积雪中分离出来的。积雪是在无菌条件下采集的。融化后，将100 μL的样本涂布在矿物琼脂K上，并在28°C下、存在正十六烷蒸汽的环境中培养。K培养基的组成（g·L^?1）为：KNO₃ – 1.0, KH₂PO₄ – 1.0, K₂HPO₄ – 1.0, NaCl – 1.0, MgSO₄ – 0.2, CaCl₂ – 0.02, FeCl₃ – 0.001, 琼脂 – 15.0；pH值为6.8–7.0。通过划线法获得了纯培养物。根据其形态特征和酶活性，该菌株最初被鉴定为Rhodococcus rhodochrous（NCBI分类号：1829）。该菌株能够氧化C₃–C₄和C₁₁–C₁₆正烷烃、硫茴香醚以及(–)-反式-香叶醇（数据未发表），并且表现出极强的耐逆境能力。它在80%正十六烷环境中仍能生长（数据未发表）；对5–40 mM的重金属具有抗性（数据未发表）；2–5%的NaCl可以促进该菌株对液态烃的吸附（数据未发表）。IEGM 639菌株已存入区域性的专性烷烃营养微生物菌库（缩写IEGM，WDCM编号768，网址：http://www.iegmcol.ru/strains/rhodoc/pyridin/r_pyridin639.html）。

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Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639的基因组使用Illumina技术进行测序。这种细菌具有耐溶剂、耐重金属和耐高盐度的特性，并能氧化多种有机化合物。所获得的序列可以用于揭示这些特性的遗传机制。

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耐逆境且对生长条件要求不高的微生物易于维护，适用于长期的生物技术过程和原位生物修复。Rhodococcus pyridinivorans IEGM 639是从俄罗斯乌拉尔地区珀姆地区的油田积雪中分离出来的。积雪是在无菌条件下采集的。融化后，将100 μL的样本涂布在矿物琼脂K上，并在28°C下、存在正十六烷蒸汽的环境中培养。K培养基的组成（g·L^?1）为：KNO₃ – 1.0, KH₂PO₄ – 1.0, K₂HPO₄ – 1.0, NaCl – 1.0, MgSO₄ – 0.2, CaCl₂ – 0.02, FeCl₃ – 0.001, 琼脂 – 15.0；pH值为6.8–7.0。通过划线法获得了纯培养物。根据其形态特征和酶活性，该菌株最初被鉴定为Rhodococcus rhodochrous（NCBI分类号：1829）。该菌株能够氧化C₃–C₄和C₁₁–C₁₆正烷烃、硫茴香醚以及(–)-反式-香叶醇（数据未发表），并且表现出极强的耐逆境能力。它在80%正十六烷环境中仍能生长（数据未发表）；对5–40 mM的重金属具有抗性（数据未发表）；2–5%的NaCl可以促进该菌株对液态烃的吸附（数据未发表）。IEGM 639菌株已存入区域性的专性烷烃营养微生物菌库（缩写IEGM，WDCM编号768，网址：http://www.iegmcol.ru/strains/rhodoc/pyridin/r_pyridin639.html）。

致谢

本项工作得到了俄罗斯联邦科学与高等教育部（项目编号124020500028-4和FSNF-2025-0013）的财政支持。实验工作使用了位于俄罗斯科学院乌拉尔分部珀姆联邦研究中心的“区域性专性烷烃营养微生物菌库”和“材料与物质研究”核心设施中心的设备。基因组草图的测序和组装工作由德国图宾根市的CeGaT GmbH公司完成（网址：www.cegat.de）。