《Phytochemistry》:Indole-diterpenoids, polyketides and oxalicine-related meroterpenoids isolated from a marine-derived Penicillium canescens strain
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针对海洋真菌卤代代谢产物挖掘不足的问题,研究人员对海水来源Penicillium canescens MMS194开展化学研究,分离得到15个化合物(含9个新结构,如6-溴-去氯pennigritrem、griseophenamide A等)。发现氯代吲哚二萜pennigritrem(3)具有显著细胞毒和抗菌活性,为卤代真菌代谢物药物开发提供了新依据。
深邃的海洋占据了地球绝大部分的表面积,其特殊的环境条件——如高盐度、高压以及独特的化学组成,孕育了无数奇特的 life forms。在这些海洋生物中,海洋来源真菌(marine-derived fungi)正逐渐成为天然产物化学家和药物开发人员眼中的“宝藏”。与已经被广泛研究过的陆生真菌相比,海洋真菌就像一个尚未被完全打开的盲盒,它们为了适应海水的高盐环境,进化出了与众不同的代谢途径,能够生产出来结构新颖且往往带有卤素(如氯、溴)的“化学兵器”——次级代谢产物。这些卤代天然产物(halogenated natural products)因其独特的电子效应和空间结构,往往在生物活性上表现优异,是抗癌、抗感染等药物开发中极具潜力的先导化合物库。
然而,尽管潜力巨大,海洋真菌次级代谢产物的研究仍然相对滞后,大量具有药用价值的“化学多样性”仍埋藏在深海或浅海的微生物世界里未被发现。正是在这种背景下,来自法国南特大学(Nantes Université)ISOMer研究所的研究团队将目光投向了一株从法国卢瓦尔河河口(La Baule, Atlantic Sea)海水中分离得到的真菌——变灰青霉(Penicillium canescens)MMS194菌株。前期基于代谢组学(metabolomics)的预研显示,该菌株能够产生多种卤代及潜在未描述的化合物。为了挖掘这些“隐藏的财富”,研究人员开展了此次全面的化学研究,成功分离并鉴定了15个化合物,涵盖了吲哚二萜(indole-diterpenoids)、聚酮类化合物(polyketides)以及草酸菌素相关类萜(oxalicine-related meroterpenoids)三大化学家族,并系统评估了它们的细胞毒、抗菌及抗病毒活性。该论文发表在天然产物与植物化学领域的重要期刊《Phytochemistry》上。
为了回答“该菌株究竟能产生哪些具体的活性代谢物”以及“这些代谢物的结构多样性和生物活性潜力如何”等核心问题,研究人员开展了一系列严谨的实验。主要关键技术方法包括:在人工添加了卤盐(KBr, KCl, NaF)的Wickerham(WKH)固体培养基上对P. canescens MMS194菌株进行扩大化培养;利用乙酸乙酯(EtOAc)对发酵产物进行提取;综合使用正相快速色谱(flash chromatography)与制备/半制备高效液相色谱(HPLC)对粗提物进行分离纯化;运用高分辨电喷雾电离质谱(HRMS-ESI)、一维/二维核磁共振(1D/2D NMR,包括1H, 13C, COSY, HSQC, HMBC, NOESY)以及时间依赖密度泛函理论-电子圆二色谱(TDDFT-ECD)进行新化合物的结构解析与绝对构型确定;此外,还利用了红外光谱(IR)和旋光测定等辅助手段。生物活性评价则包括:针对7种癌细胞系及正常人皮肤成纤维细胞的细胞毒性(MTT/Hoechst 33342 assay,计算IC50)、针对ESKAPE病原菌面板(如MRSA, E. faecium等)的抗菌活性(resazurin assay,计算IC50)以及针对人类冠状病毒HCoV-229E的抗病毒活性评价。样本来源于实验室保藏的MMS194菌株(GenBank: MN202465, MN133997)。
2. Results and discussion
2.1. Structure Elucidation of Indole Diterpenoids
研究人员首先从该真菌提取物中分离得到了7个吲哚二萜类化合物(1-7)。通过详细的核磁共振数据分析及与已知化合物pennigritrem(3)的对比,鉴定化合物1为6-bromo-dechloropennigritrem(6-溴-去氯pennigritrem),这是一个新的溴代吲哚二萜,其溴原子位于吲哚环的C-6位。化合物2被鉴定为dechloropennigritrem(去氯pennigritrem),即pennigritrem的非卤代类似物,同样为新化合物。已知化合物3即为pennigritrem,已知化合物7为10-oxo-11,33-dihydropenitrem B。此外,还发现了新的thomitrem E衍生物:化合物4(10-oxo-11,33-dihydrothomitrem E)、化合物5(10-oxo-11,33-dihydro-26-2-hydroxyisopropylthomitrem E)和化合物6(10-oxo-11,33-dihydro-26-2-hydroxyisopropylpenitrem E,与5混合存在)。结构解析主要依赖于HRMS推断分子式,通过1H和13C NMR化学位移变化确定取代基位置和卤素类型,并利用COSY、HMBC相关确定平面结构,通过NOE相关及与文献数据对比确定相对构型,最后通过TDDFT-ECD计算验证了绝对构型。
2.2. Structure Elucidation of Polyketides
在聚酮类化合物部分,研究分离得到了化合物8、9以及相关已知物。化合物8被鉴定为一个极其有趣的新结构,命名为griseophenamide A(灰酚酰胺A)。初步的HRMS和NMR数据显示其与已知的griseophenone A(灰酚酮A)相似,但含有一个额外的氮原子。详细的HMBC相关分析和红外光谱(IR)显示,连接两个芳香环的不再是酮基(C=O,约201.0 ppm),而是一个酰胺键(amide bond,C=O 169.8 ppm,IR band 1668 cm-1)。据作者所知,这是首次从天然来源中分离得到此类酰胺类似物(虽已有化学合成报道),其生物合成途径可能不同于典型的聚酮途径,且在该真菌的基因组中未初步发现典型的NRPS(非核糖体肽合成酶)模块,其天然来源还需进一步验证。化合物9被鉴定为desmethyl-dehydrogriseofulvin(去甲基-脱氢灰黄霉素),虽然是已知化合物,但这是首次作为天然产物(而非合成中间体)被分离得到。
2.3. Structure Elucidation of Oxalicine Related Meroterpenoids
第三大类为草酸菌素(oxalicine)相关的混源萜类化合物(10-15)。化合物10被确定为新的15-deoxy-18-hydroxyoxalicine B(15-去氧-18-羟基草酸菌素B),通过在C-18位引入羟基区别于已知的15-deoxyoxalicine B(11)。化合物12为新化合物15-deoxy-16,17-dihydroxyoxalicine B(15-去氧-16,17-二羟基草酸菌素B),其C-16和C-17位的双键被两个羟基取代。化合物13同样为新结构,被鉴定为15-deoxy-16,17-epoxyoxalicine B(15-去氧-16,17-环氧草酸菌素B),含有罕见的环氧结构(这也是首次在oxalicine-type化合物中描述环氧功能),它与12以混合物形式存在。已知化合物还包括15-deoxyoxalicine B (11)、decaturin A (14) 和 decaturin F (15)。
2.4. Bioactivity Evaluation
2.4.1. Cytotoxicity
细胞毒性评价显示,在测试的众多化合物中,只有氯代吲哚二萜pennigritrem (3) 和 10-oxo-11,33-dihydropenitrem B (7) 表现出明显的活性。其中,化合物3对结直肠癌细胞系Caco-2和HCT116表现出最佳的 cytotoxic活性,IC50值分别为5.0 μM和8.0 μM,同时对乳腺癌细胞系(MDA-MB-468, MCF7)和前列腺癌细胞系(PC3)也显示出中等活性(IC5013-26 μM),且对正常成纤维细胞无明显的非特异性毒性,显示出较好的选择性。化合物7则表现出中等强度的细胞毒活性,但缺乏选择性(对正常 fibroblasts同样有毒)。
2.4.2. Antimicrobial activity
抗菌实验针对ESKAPE病原菌面板。氯代化合物3再次表现最佳,对屎肠球菌(E. faecium)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)具有中等抗菌活性,IC50值分别为30.3 μM和34.8 μM。其非卤代类似物2仅对MRSA有边际活性,而溴代类似物1也能抑制MRSA生长(86% inhibition at 100 μg/mL)。此外,化合物7和9(desmethyl-dehydrogriseofulvin)对MRSA也显示出一定的抑制率(40%和41%)。
2.4.3. Antiviral activity
抗人冠状病毒HCoV-229E的测试结果显示,在所试浓度下,化合物7(20%-48% inhibition)和新化合物8(55% inhibition at 25 μM)表现出一定的抑制趋势,但未达到显著抗病毒标准(>90% inhibition),其余化合物未显示明显活性。
2.4.4. Conclusion
综合上述结果,讨论部分指出,尽管卤代天然产物在总体海洋天然产物中占比不高(15-20%),但本研究从单一菌株中就分离得到了4个卤代化合物(1, 3, 8, 9),其中2个为新结构(1, 8),这凸显了靶向卤代产物研究的价值。特别值得注意的是,氯代吲哚二萜pennigritrem (3) 的生物活性明显优于其溴代类似物 (1) 和非卤代类似物 (2),暗示了氯原子的存在可能增强了此类pennigritrem-like化合物的细胞毒和抗菌效力。此外,具有闭合8元环的penitrem型化合物(如3和7)比开环的thomitrem型化合物(如4)表现出更好的生物活性,提示了特定的环系结构对活性至关重要。对于聚酮类化合物,酰胺键的引入(化合物8)可能导致了其失去母核(griseophenone A)原有的细胞毒和抗病毒活性;而去甲基脱氢灰黄霉素(9)仅有微弱的抗菌活性,表明结构修饰易导致灰黄霉素类活性丧失。草酸菌素类化合物在本研究测试模型中虽无显著活性,但因无明显细胞毒性,仍是值得关注的其他药物靶点候选者。
总体而言,这项研究工作不仅极大地丰富了P. canescens这一物种的化学多样性档案,特别是揭示了其为卤代真菌代谢物的重要生产者,而且通过对分离化合物的生物活性评价,明确了氯代吲哚二萜pennigritrem具有成为抗肿瘤和抗菌候选药物的潜力。这为后续从海洋真菌,尤其是青霉属真菌中寻找结构独特、活性显著的卤代天然产物,进而为新型抗生素或抗癌药物的开发提供了重要的科学依据和先导分子。