绵羊的亲本来源效应：对数据拟合度、模型解释能力以及育种值理论准确性的影响

《Scientific Reports》：Parent-of-origin effects in sheep: impact on the data fit, explanatory power of the model and theoretical accuracy of the breeding values

　　

摘要

尽管父母起源效应早已被人们所认识，但关于它们与绵羊生长相关性状的关联知之甚少。特别是，目前尚不清楚这些效应是否能够提高育种值的理论准确性。本研究探讨了在遗传评估模型中纳入父母起源效应对数据拟合度、模型解释能力以及育种值理论准确性的影响，研究对象包括Moghani绵羊的出生体重（BW）、断奶体重（WW）、6个月龄体重（W6）以及断奶前后的日均增重（ADGa和ADGb）。研究采用两步法进行：第一步，使用包含不同直接效应和母体效应组合的6个动物模型对每个性状进行分析，并通过赤池信息量准则（AIC）选出最佳模型（模型I）；第二步，在模型I的基础上加入母体印记效应、父体印记效应或两者兼有，以判断这些效应是否能够提升模型的拟合度。最终确定每个性状的最佳模型。模型的解释能力通过预测均方误差（MSE）以及观测值与预测值之间的皮尔逊相关系数（r(\(y\),\(y\),\({{\varvec{h}}}_{{\varvec{m}}{\varvec{i}}}^{2}\) = 0.06?±?0.03（BW）、0.10?±?0.01（WW）、0.10?±?0.05（W6）和0.17?±?0.09（ADGa）；直接遗传力的范围为0.02?±?0.02（W6）至0.13?±?0.04（ADGa）。虽然各性状间的母体印记相关性均为正相关（范围从0.56?±?0.31（W6-ADGa）到0.99?±?0.18（WW-W6），但性状间的直接加性遗传相关性低于母体印记相关性，范围从-0.17?±?0.06（BW-ADGb）到0.94?±?0.05（WW-W6）。由于在模型中纳入印记效应能够提升模型的解释能力、改善数据拟合度并显著提高加性育种值的理论准确性，因此建议在Moghani绵羊生长性状的遗传评估中加入印记效应。