《Journal of Microbiological Methods》：Oral cavity samples as a non-invasive method for respiratory virus detection in Pediatric patients: A comparative study
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劳拉·里亚斯科斯·奥尔胡埃拉（Laura Riascos Orjuela）|埃莉安娜·帕特里夏·卡尔沃（Eliana Patricia Calvo）|卡罗琳娜·科罗内尔-鲁伊斯（Carolina Coronel-Ruiz）|霍安娜·马德罗涅罗（Johana Madro?ero）|
劳拉·里亚斯科斯·奥尔胡埃拉（Laura Riascos Orjuela）|埃莉安娜·帕特里夏·卡尔沃（Eliana Patricia Calvo）|卡罗琳娜·科罗内尔-鲁伊斯（Carolina Coronel-Ruiz）|霍安娜·马德罗涅罗（Johana Madro?ero）|努里·梅尔昌·卡斯特利亚诺斯（Nuri Merchán Castellanos）|索尼娅·德尔·皮拉尔·博奥尔克斯·阿维拉（Sonia del Pilar Bohórquez ávila）|赫尔曼·卡马乔·莫雷诺（Germán Camacho Moreno）|海梅·E·卡斯特利亚诺斯（Jaime E. Castellanos）
哥伦比亚波哥大埃尔博斯克大学（Universidad el Bosque）研究副校长办公室病毒学实验室，邮编110121
摘要
引言
呼吸道病毒是全球急性呼吸道感染（ARI）的主要原因。尽管采取了预防措施，这些感染仍然是儿童发病率和死亡率的重要因素。在哥伦比亚，最常见的病毒包括呼吸道合胞病毒（RSV）、流感病毒（Influenza）、鼻病毒（Rhinovirus）、腺病毒（Adenovirus）和SARS-CoV-2。虽然及时检测对于有效治疗和监测至关重要，但标准的诊断方法（如鼻咽拭子采样（NPS）和吸痰采样（NPA）具有侵入性、不适感强，且常常难以被儿童接受。因此，人们越来越关注非侵入性替代方法，如口腔拭子和唾液样本，这些方法更容易采集且更具成本效益。
目的
评估口腔样本作为检测呼吸道病毒的非侵入性方法的实用性。
方法
我们进行了一项配对比较研究，纳入了133名出现急性呼吸道疾病症状的儿童患者。每位患者均采集了NPA和OC样本，并使用多重RT-qPCR检测技术对五种呼吸道病毒进行了分析。通过Cohen's kappa系数评估了两种采样方法之间的一致性。
结果
结果显示，OC样本在检测FluA（κ = 0.755）和RSV（κ = 0.693）方面与NPA样本具有显著一致性，而在检测AdV（κ = 0.404）方面一致性较弱。由于阳性样本数量较少，无法确定FluB和SARS-CoV-2的检测结果是否一致。
结论
这些发现支持将口腔采样作为一种可行的非侵入性方法来检测儿童中的特定呼吸道病毒，同时也强调了不同病毒在检测性能上的差异。
