从过度富集的双核苷酸修饰DNA文库中，通过简便的单轮筛选方法获得靶向胰岛素受体的超修饰适配体

《Nature Communications》：Expedient single-round selection of hyper-modified aptamer targeting insulin receptor from over-represented dually nucleobase-modified DNA libraries

　　

摘要

从随机文库中发现功能性核酸通常依赖于多轮耗时的体外筛选，但成功率较低。在这里，我们提出了一种单轮筛选策略，可以快速筛选多种过表达的核碱基修饰DNA文库，并适用于多种筛选条件，从而能够识别出高亲和力的修饰适配体。通过双分配法对洗脱后的序列进行扩增，结合下一代测序（NGS）分析和聚类处理，可以快速确定适配体候选分子。对含有修饰腺嘌呤和尿嘧啶核苷酸的DNA文库进行筛选（这些核苷酸带有疏水性芳香基团如苯基和吲哚基），成功开发出一种能与人类胰岛素受体结合的适配体，其结合亲和力低于纳摩尔级别且具有极高的特异性。冷冻电镜（Cryo-EM）结构分析揭示了这些芳香基团的重要性：它们既有助于稳定适配体的二级结构，又能促进其与蛋白质表面的相互作用。这种方法解决了适配体筛选中的主要问题，具有高通量筛选的潜力，并有望加速下一代适配体的开发，用于诊断或治疗领域。