《Journal of Virological Methods》：Evaluation of a semi-automated method for detection of cytomegalovirus DNA in multiple sample types
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Kerusha Govender | Isabelle Boucoiran | Fatima Kakkar | Ariane Larouche | Jing Hu | Hinatea Dieumegard | Niki Abdollahi | Mi-Suk Kang Dufour
Kerusha Govender | Isabelle Boucoiran | Fatima Kakkar | Ariane Larouche | Jing Hu | Hinatea Dieumegard | Niki Abdollahi | Mi-Suk Kang Dufour | Christian Renaud | Marc Desforges | Soren Gantt
阿兹里埃利研究中心（Azrieli Research Centre），位于加拿大魁北克省蒙特利尔市Sainte-Justine大学医院中心，地址：3175 chemin de la C?te Sainte-Catherine
摘要
巨细胞病毒（CMV）是最常见的先天性感染，也是导致儿童残疾的重要原因。新生儿CMV筛查和母婴传播研究日益普遍，这些研究涉及使用多种样本类型进行病毒检测。本文描述了对AltoStar? CMV PCR Kit 1.5的分析评估，这是一种用于检测与先天性CMV感染相关的多种样本类型中CMV DNA的商业诊断平台。研究人员在已知CMV阴性的供体样本中添加了已知浓度的病毒分离株，包括口腔拭子、唾液、干尿斑（DUS）和干血滤纸斑（DBS）、脐带血、羊水、胎盘组织、阴道拭子以及母乳。液体样本的检测线性范围为0.96至1.00；检测限范围为2.22至2.83 log IU/ml。使用Quanta Extracta DBS缓冲液（QuantaBio）进行仪器外核酸纯化处理后，对干尿斑样本的CMV PCR检测灵敏度更高。本研究为先天性感染研究和新生儿筛查中的CMV分子检测提供了跨样本类型的性能评估框架。AltoStar? CMV PCR平台在临床相关样本类型中表现出稳健的性能，并具有可扩展的通量能力，支持其在大规模流行病学和筛查应用中的使用。
章节摘录
背景
巨细胞病毒（CMV）感染较为常见，如果在子宫内感染或新生儿出生后感染，可能会导致严重并发症。全球约1%的活产婴儿患有先天性CMV感染（cCMV），且临床诊断往往较为困难（Bartlett等人，2017年；Uematsu等人，2016年）。因此，人们越来越关注使用婴儿血液、唾液或尿液样本进行新生儿CMV筛查（Lazzarotto等人，2020年；Gantt，2023年）。开发CMV疫苗也是一个重要的研究方向。
伦理声明
本研究遵循Sainte-Justine大学医院中心的研究伦理政策。血液、尿液、胎盘和唾液样本均来自CARMA-CMV队列（妊娠期间CMV的动态与传播，2026年）的孕妇参与者，并获得了他们的书面知情同意。羊水及母乳样本则由Sainte-Justine大学医院中心的临床实验室和Héma-Quebec母乳库提供。
结果
共对1,697份添加了病毒样本的临床样本进行了CMV PCR检测（每种临床样本平均重复130次）。38次检测中有37次有效，即阳性和阴性对照都在预期范围内；有1次检测失败。有效检测的PCR扩增效率平均为100.6%（范围：91.8%至107.7%）。不同样本类型的R2线性相关性范围为0.64至1.00，精密度范围为0.80%至6.09% CV。
讨论
在本研究中，我们对AltoStar? CMV PCR Kit 1.5在适用于先天性CMV研究和潜在筛查应用的多种样本类型中的性能进行了分析评估。该商业平台专为高通量临床诊断测试而设计，配备了全自动的AltoStar? AM16自动化系统（altona Diagnostics GmbH），该系统能够减少样本纯化和PCR设置过程中的手动操作时间。
CRediT作者贡献声明
Isabelle Boucoiran：撰写、审稿与编辑、监督、资源协调、项目管理、方法学设计、数据管理、概念构思。Fatima Kakkar：撰写、审稿与编辑、监督、资源协调、项目管理、方法学设计、资金筹集、数据管理。Soren Gantt：撰写、审稿与编辑、验证、监督、项目管理、方法学设计、研究实施、资金筹集、数据分析、数据管理、概念构思。Kerusha Govender：撰写
作者声明以下可能被视为潜在利益冲突的财务利益和个人关系：CARMA-CMV队列研究由加拿大卫生研究院（Canadian Institutes for Health Research）资助。本研究使用的所有试剂和设备均由Altona公司捐赠。研究人员独立于Altona公司制定了研究方案、分析数据、解释结果并起草了论文。SG表示曾接受过Moderna、Merck、GSK和Pfizer公司的研究资助。
致谢
作者感谢Sheila Dollard分享她在干尿和干血斑处理方面的专业知识及经验，以及这些技术在CMV筛查中的应用。同时，我们也感谢Altona公司的团队（S?nke Friedrichsen、Jan Jarck等人）慷慨分享他们的验证实验经验。
CARMA-CMV队列研究由加拿大卫生研究院资助。本研究使用的所有试剂和设备均由Altona公司捐赠。
