《Journal of Integrative Agriculture》：GWAS identifies major loci for agronomic and yield-related traits in wheat through cross-population validation
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洪素敏（Sumin Hong）|孙在汉（Jae-Han Son）|姜重植（Chon-Sik Kang）|崔昌铉（Changhyun Choi）|莫英俊（Youngjun Mo）|金在允（Jae Yoon Kim）|金大妍（Dae Yeon Kim）|金庆民（Kyeong-Min
洪素敏（Sumin Hong）|孙在汉（Jae-Han Son）|姜重植（Chon-Sik Kang）|崔昌铉（Changhyun Choi）|莫英俊（Youngjun Mo）|金在允（Jae Yoon Kim）|金大妍（Dae Yeon Kim）|金庆民（Kyeong-Min Kim）|朴哲秀（Chul Soo Park）
韩国全北国立大学作物科学与生物技术系，全州市 54896
摘要
优化小麦的抽穗期和关键农艺性状对于其适应多种种植系统至关重要。全基因组关联研究（GWAS）已经发现了许多与这些性状相关的基因位点。然而，这些关联在不同遗传背景下的稳定性和可转移性仍然有限。在本研究中，我们利用461份韩国小麦样本对六个农艺性状进行了GWAS分析，并在来自48个国家的206份全球多样性样本中验证了主要基因位点。我们发现了22个标记-性状关联（MTAs），其中包括6个对表型方差解释率（PVE）≥10%的主要效应位点。其中5个位点被转化为竞争性等位基因特异性PCR（KASP）标记，所有这些标记在全球验证样本中均表现出一致的等位基因效应，证实了它们在不同遗传背景下的可转移性。三个经过验证的基因位点与具有功能特征的基因相关：3B染色体上的GIGANTEA基因位点与抽穗期相关，2D染色体上的Rht8相关区域与穗紧凑性相关，5A染色体上的B1区间与芒抑制相关。GIGANTEA相关等位基因使抽穗期提前5.3–7.7天，且不影响每穗的籽粒数。Rht8相关位点缩短了穗长，同时保持了小穗数量。B1相关位点缩短了芒的长度，但没有降低产量。另外两个经过验证的基因位点（2B染色体上的抽穗期相关位点和5A染色体上的茎秆长度相关位点）与之前未表征的基因相关。这些结果表明，通过区域GWAS鉴定出的主要基因位点能够在全球多样化的遗传背景下保持稳定的效应，并为全球小麦育种提供可转移的KASP标记。这突显了将区域特异性发现与跨群体验证相结合的价值。
