高质量基因组组装、代谢组、泛基因组以及Megasphaera hexanoica KCCM 43214T的代谢模型

《Scientific Data》：High-Quality Genome Assembly, Metabolome, Pangenome, and Metabolic Models of Megasphaera hexanoica KCCM 43214T

　　

摘要

Megasphaera hexanoica KCCM 43214^T 来自牛的瘤胃，能够产生中链羧酸，如己酸和辛酸。在这项研究中，我们提供了高质量的基因组组装结果，以及细胞内代谢组学分析和全基因组分析。Illumina测序产生了2.3 Gbp的序列数据，共15,293,634条读段，GC含量为49.5%；而PacBio HiFi测序产生了331.5 Mbp的序列数据，共45,266条读段，平均读长为7,323 bp，HiFi读段的N50值为8,214 bp。通过短读段和长读段的混合组装，得到了一个长度为2.88 Mbp的连续序列，其中包含2,835个蛋白质编码基因。构建了基因组规模的代谢模型来评估其在特定生长条件下的代谢能力。对在含有果糖和乳酸的培养基中生长的细胞进行细胞内代谢组学分析，发现了与链延长相关的关键代谢活动。通过对九个已注释基因组进行全基因组分析，使用OrthoMCL工具识别出6,721个同源基因，这突显了Megasphaera属内的遗传和功能多样性。该数据集为了解M. hexanoica KCCM 43214^T的代谢特性和生物技术潜力提供了宝贵的信息。