中国内蒙古一例皮肤炭疽病例中炭疽杆菌的致病性特征分析及全基因组进化研究

《BMC Microbiology》：Pathogenic characterization and genome-wide evolutionary analysis of Bacillus anthracis from a cutaneous anthrax case in Inner Mongolia, China

　　

摘要

背景

在中国的牧区，炭疽病仍然是一种重要的动物源性疾病。然而，对于内蒙古兴安盟地区而言，直接将人类病例、受污染的动物产品与环境源头联系起来的基因组证据仍然有限。我们调查了2023年报告的一起皮肤炭疽病例，并利用流行病学和基因组学方法对相关的炭疽杆菌分离株进行了分析。

方法

2023年11月2日接到疑似病例报告后，我们立即展开了现场调查。从患者、被屠宰的羊的残留物以及当地环境中收集了18个样本。通过实时PCR检测到炭疽杆菌，并通过培养并进行表型鉴定将其分离出来。其中4个分离株接受了canSNP分型、短读长全基因组测序、平均核苷酸身份（ANI）分析以及基于核心基因组的多位点序列分型（cgMLST）鉴定，这些分析都是以公开的基因组数据集为参考的。

结果

在患者屠宰并剥去一只濒死羊的皮后，确认了一例皮肤炭疽病例。18个样本中有4个样本呈PCR阳性，从患者、羊肉、羊皮和运输工具中分离出了4株炭疽杆菌。这4个分离株均属于A.Br.001/002谱系，并且在整个基因组范围内表现出极高的相似性。结合流行病学证据和cgMLST结果，可以确定这是一起由单一源头引发的疫情，涉及受感染的羊、受污染的动物产品、运输环境以及人类病例。

结论

本研究记录了一起与屠宰受感染羊相关的局部性动物源性疾病暴发事件，证明了在牧区环境中将常规微生物学调查与基于基因组的分型技术相结合对于追踪源头的重要性。