多组学分析及胆汁酸暴露检测表明，肠道微生物群与寄生虫之间存在关联，而这又与溶组织内阿米巴的持续携带有关

《Gut Pathogens》：Multi-omics profiling and bile-acid exposure assays implicate a gut microbiome–parasite axis linked to persistent Entamoeba histolytica carriage

　　

摘要

背景

无症状的溶组织内阿米巴携带者是重要的传播源，但肠道生态系统——尤其是由微生物产生的代谢物如次级胆酸——是如何帮助寄生虫持续定植的，目前尚不清楚。我们研究了肠道微生物组及代谢物特征是否与溶组织内阿米巴携带状态相关，以及是否会影响寄生虫的表型。

方法

我们将从前瞻性筛选的门诊患者群体（n=36）中获得的宏基因组数据与功能体外试验相结合。通过有序逐步模型分析不同的检测状态（无溶组织内阿米巴、Eh_qPCR阳性、溶组织内阿米巴囊体阳性），确定潜在的微生物特征，随后通过胆酸暴露试验和转录组分析来评估这些特征对寄生虫适应能力及体外甲硝唑敏感性的影响。

结果

微生物组分析显示的是特定类群的改变，而非整体生态失衡。社区层面的β多样性没有显著差异，但溶组织内阿米巴囊体阳性组的属丰富度更高（未调整p值=0.046）。多变量建模显示出一致的方向性趋势，但均不显著（q值均大于0.9），由此推断厚壁菌门的某些属，如粪球菌、反刍球菌和链杆菌属可能是候选类群。接着我们研究了由微生物修饰后的次级胆酸——脱氧胆酸。体外实验表明，100 μM浓度的脱氧胆酸能在营养受限条件下延长溶组织内阿米巴的存活时间，并降低其经预处理后的甲硝唑敏感性。转录组分析显示，脱氧胆酸引发了特定的反应，包括ABC转运蛋白P-糖蛋白-2的表达增加了8.34倍，同时脂质重塑和应激反应基因也出现上调，这表明脱氧胆酸促使寄生虫产生了有助于其在肠道中持续存在的适应性机制。

结论

我们的研究结果表明，以脱氧胆酸为代表的次级胆酸能够重新调控溶组织内阿米巴的基因表达，从而降低其在体外对甲硝唑的敏感性。结合与囊体相关的微生物组特征，这一发现支持了“微生物组-胆酸-寄生虫”相互作用轴的存在可能性，这种相互作用可能有助于无症状携带者的寄生虫持续存在，同时也可能影响治疗效果。