IGF2BP家族基因中的遗传变异与中国儿童的胶质瘤发病风险相关

《Molecular Medicine》：Genetic variants in IGF2BP family genes are associated with glioma risk in Chinese children

　　

摘要

背景

胶质瘤是儿童中枢神经系统中极为常见的恶性肿瘤，其发病与复杂的遗传和环境因素密切相关。IGF2BP家族基因（IGF2BP1、IGF2BP2和IGF2BP3）编码重要的RNA表观遗传“读取器”，参与转录后基因调控并影响多种细胞过程。然而，这些基因变异对胶质瘤发病风险的贡献至今仍不明确。

方法

本研究为多中心病例对照研究，纳入360名胶质瘤患者和547名无癌症的对照组。采用TaqMan检测技术对IGF2BP家族基因中的11种潜在功能性多态性进行基因分型。通过条件逻辑回归模型计算比值比及95%置信区间。此外，还通过表达量遗传学定位分析以及癌症基因组图谱的临床数据库分析，探究所识别变异的潜在调控机制及临床意义。

结果

研究发现：IGF2BP1的rs2270575多态性与胶质瘤发病风险降低显著相关，而IGF2BP2的rs17289925和rs7646419多态性则与发病风险升高相关。分层分析和累积效应分析表明，携带多个IGF2BP1或IGF2BP2的风险基因型会显著增加患胶质瘤的易感性。在男性、60个月以下的幼儿以及被诊断为早期（I+II期）肿瘤的患者中，这种累积风险更为明显。此外，表达量遗传学定位分析和癌症基因组图谱分析显示，rs2270575和rs7646419等位基因分别与CALCOCO2和AC099661.1（ENSG00000286086）的mRNA表达水平变化存在显著关联，而这些变化又与更有利的分子亚型（IDH突变状态）及WHO肿瘤分级相关。

结论

IGF2BP家族基因中的遗传多态性会显著影响儿童胶质瘤的易感性，且具有累积效应、亚型特异性及年龄依赖性；因此，这些基因有望作为无创生物标志物，用于儿童胶质瘤的早期风险分层。