特发性膜性肾病患者尿液中编码与非编码RNA差异表达及关联的转录组分析

《Biology Direct》：Transcriptomic analysis of differential expression and correlation of coding and non-coding RNAs in urine from patients with idiopathic membranous nephropathy

　　

摘要

背景

特发性膜性肾病（IMN）的发病率正在上升，其发病机制至今仍不明确。因此有必要探索新的诊断分子标志物以及IMN的分子机制。

方法

本研究招募了15名健康对照者和15名IMN患者。收集并分析了所有参与者的临床基线数据，包括年龄、性别和体重指数（BMI），以及组织病理学分期（Ehrenreich-Churg分类）和磷脂酶A2受体（PLA2R）的免疫组化染色结果。同时，获取了外周血和尿液样本，用于检测与肾功能相关的生化指标，如血清肌酐（Scr）、估算的肾小球滤过率（eGFR）、血清白蛋白、24小时尿蛋白量（24 h UPT）、血清总胆固醇（TC）、抗PLA2R抗体滴度以及血清免疫球蛋白G（IgG）。另有10份尿液样本被用于高通量测序分析。

结果

IMN组患者的血清白蛋白水平显著降低，而24 h UPT、TC、抗PLA2R抗体滴度和IgG水平则有所升高。通过微RNA（miRNA）转录组分析，发现了34种差异表达的miRNA。经ROC曲线分析，Hsa-miR-576-3p、hsa-miR-766-5p和NovelmiRNA-837具有较高的诊断潜力（AUC＞0.8）。在IMN组织中发现了64种差异表达的mRNA，这些mRNA多与核糖体及MAPK信号通路相关。ENST00000481739（RXRA）在IMN中表达升高，且与抗PLA2R抗体滴度相关，同样具有诊断潜力（AUC=0.929）。此外，在IMN中还发现了35种差异表达的长链非编码RNA，这些lncRNA多与自噬、线粒体吞噬和细胞凋亡通路相关。TCONS_00180924、TCONS_00176280和TCONS_00208611与TC、24小时尿蛋白量和抗PLA2R抗体滴度存在显著相关性。

结论

本研究为开发IMN的无创诊断工具及靶向疗法奠定了基础。