《International Journal of Molecular Sciences》:Genetic Determinants of Severe Hypertriglyceridemia: Rare Variants in LPL, APOC2, APOA5, GPIHBP1, LMF1, APOE and Polygenic Risk
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严重高甘油三酯血症(HTG)在遗传上是异质性的,但其遗传结构仍未完全明确。研究人员在123名甘油三酯(TG)水平>5.0 mmol/L且具备NGS数据的患者中研究了严重HTG的遗传决定因素。研究人员分析了LPL、APOC2、APOA5、GPIHBP1、LMF1
严重高甘油三酯血症(HTG)在遗传上是异质性的,但其遗传结构仍未完全明确。研究人员在123名甘油三酯(TG)水平>5.0 mmol/L且具备NGS数据的患者中研究了严重HTG的遗传决定因素。研究人员分析了LPL、APOC2、APOA5、GPIHBP1、LMF1和APOE中的罕见变异;ε2/ε2 APOE基因型;以及基于40个变异的TG-多基因风险评分(PRS)。在65.0%的个体中鉴定出主要遗传决定因素,包括乳糜微粒血症基因中的罕见变异(24.4%;28个变异,包括10个新变异,53.6%位于LPL),罕见APOE变异或ε2/ε2基因型(18.7%,与乳糜微粒血症变异重叠4.1%),以及极端多基因负荷(35.8%;PRS>90th百分位),包括26.0%的孤立多基因HTG。剩余35.0%具有中等至低PRS。根据遗传决定因素,队列被分为家族性乳糜微粒血症综合征(FCS,n=7)、多因素乳糜微粒血症综合征(MCS,n=21)、多基因HTG(n=32)、家族性异常β脂蛋白血症(FD,n=20)和中等至低PRS(n=43)组。FCS具有最低的PRS百分位(中位数26)和最独特的临床特征,具有最高的TG水平(中位数30.60 mmol/L)以及与其他组相比6–24倍的胰腺炎风险(p<0.05),同时体重指数(中位数23.0 kg/m2)低于除MCS外的所有组,而FD具有最低的TG水平(10.20 mmol/L,p<0.05)。这些结果进一步推进了对严重HTG复杂遗传结构的理解,并表明更广泛的遗传分析,包括APOE和TG-PRS,可能提高严重HTG遗传决定因素的检出率。
**严重高甘油三酯血症的遗传决定因素:综合基因组学分析揭示罕见变异与多基因风险的异质性**
**1. 研究背景与目的**
高甘油三酯血症(hypertriglyceridemia, HTG)是一种常见的血脂异常,通常以空腹甘油三酯(triglyceride, TG)>1.7 mmol/L为诊断标准,其中TG>5.65 mmol/L被定义为严重HTG,>10.0 mmol/L为极端HTG。严重HTG与胰腺炎和动脉粥样硬化性心血管疾病的风险显著相关。在遗传层面,HTG具有高度异质性:家族性乳糜微粒血症综合征(familial chylomicronemia syndrome, FCS)由脂蛋白脂肪酶(LPL)通路关键基因(LPL、APOC2、APOA5、GPIHBP1、LMF1)的双等位基因致病性变异引起;多因素乳糜微粒血症综合征(multifactorial chylomicronemia syndrome, MCS)由单个杂合变异或多个意义未明变异(variant of uncertain significance, VUS)累积导致;此外,APOE罕见变异或ε
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2基因型与家族性异常β脂蛋白血症(familial dysbetalipoproteinemia, FD)相关;而大部分成人严重HTG可能为多基因性,反映多个TG升高变异与非遗传因素的累积效应。然而,既往研究多集中于经典乳糜微粒血症基因,对多基因风险的评估有限,且缺乏在东欧人群中的全面遗传特征描述。为此,本研究联合分析了经典乳糜微粒血症基因、APOE以及TG多基因风险评分(polygenic risk score, PRS),旨在揭示严重HTG的遗传全貌,并比较不同遗传亚组的临床特征。该论文发表在《International Journal of Molecular Sciences》。
**2. 研究设计与关键技术方法**
研究样本来源于俄罗斯国家医学研究中心治疗与预防医学研究所(NMRC for Therapy and Preventive Medicine, Moscow, Russia)生物样本库,纳入123名TG>5.0 mmol/L的无关索引患者。关键技术方法包括:(1)靶向下一代测序(next-generation sequencing, NGS),使用定制panel(NextSeq 550平台)对5个经典乳糜微粒血症基因(LPL、APOC2、APOA5、GPIHBP1、LMF1)及APOE进行测序,并通过Sanger测序验证;(2)生物信息学分析,包括基于GRCh38/hg38参考基因组的比对、变异注释(CADD v1.7)、依据ACMG/AMP2015指南进行致病性分类;(3)TG-PRS计算,基于既往研究中与TG水平显著关联的40个常见变异的β系数,并以>90
th百分位定义为极端多基因负荷;(4)统计比较,使用Mann-Whitney U检验、多变量线性回归(调整性别、年龄、降脂治疗)、Firth惩罚逻辑回归等分析遗传亚组间的临床差异。
**3. 研究结果**
**3.1 研究对象特征**
通过临床和生化数据描述,123名患者中位年龄48岁,59.3%为男性,72.4%具有极端TG水平(>10.0 mmol/L)。大多数患者(86.0%)体重指数(body mass index, BMI)>24.9 kg/m
2,33.3%患有2型糖尿病,25.9%有胰腺炎病史,约四分之一患有冠状动脉疾病。
**3.2 乳糜微粒血症基因和APOE的罕见变异及ε
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2基因型**
通过NGS分析,在39.0%的患者中鉴定出经典乳糜微粒血症基因或APOE的罕见变异或ε
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2基因型。
**3.2.1 乳糜微粒血症基因的罕见变异**:在24.4%的患者中(30例)发现28个罕见变异,其中53.6%位于LPL,其次是APOA5(21.4%)、GPIHBP1(10.7%)等。错义变异占75.0%,57.1%的缺失功能变异位于LPL。15个(53.6%)变异被分类为致病性或可能致病性,并鉴定出10个新报道变异(包括LPL和APOC2的移码变异及LPL的大片段重复)。
**3.2.2 基于基因型的FCS和MCS分层**:7例(5.7%)符合FCS遗传标准(双等位基因或双重杂合致病性变异),其中85.7%为双等位基因携带者,LPL为最常见基因(71.4%);23例(18.7%)鉴定为变异阳性MCS(单个杂合致病性变异、致病性变异联合VUS、或仅VUS)。
**3.2.3 APOE变异与ε
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2基因型**:18.7%的患者携带APOE罕见变异(9.8%)或ε
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2基因型(8.9%),其中APOE p.Arg154Cys变异最常见(41.7%)。
**3.3 常见TG升高变异的累积**
通过计算TG-PRS,35.8%的患者(44例)具有极端多基因贡献(PRS>90
th百分位),其中26.0%为孤立多基因HTG(无罕见变异或ε
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2),9.8%同时携带罕见变异/ε
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2和极端PRS。剩余35.0%的患者PRS介于中等至低水平。
**3.4 乳糜微粒血症基因变异、APOE与极端PRS的重叠**
5例患者(4.1%)同时携带乳糜微粒血症基因变异和APOE变异/ε
2/ε
2,其中位PRS百分位为54,无一例具有极端PRS。
**3.5 不同遗传亚组的临床特征与PRS百分位比较**
根据遗传发现将队列分为五组(FCS、MCS、多基因HTG、FD、中等至低PRS组),调整协变量后比较:
- **TG水平**:FCS组TG水平最高(中位30.60 mmol/L),FD组最低(10.20 mmol/L),差异均显著(p<0.05)。
- **胰腺炎风险**:FCS组胰腺炎风险显著高于其他四组(比值比6–24倍,p<0.05)。
- **BMI**:FCS组BMI显著低于FD、多基因HTG和中等至低PRS组(平均差-5.6至-6.8 kg/m
2)。
- **PRS百分位**:FCS组PRS百分位最低(中位26),显著低于MCS、中等至低PRS和FD组;FD组PRS百分位高于中等至低PRS组(边界显著)。
**4. 讨论与结论总结**
讨论部分指出,本研究的主要优势在于整合分析了经典乳糜微粒血症基因、APOE变异/ε
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2基因型及TG-PRS,在65.0%的严重HTG患者中鉴定出主要遗传决定因素,这一检出率与既往国际研究(24.3–67.5%)一致。研究首次在东欧人群中进行了全面评估,发现LPL变异在FCS中占主导(71.4%),APOE相关遗传成分(18.7%)与乳糜微粒血症基因变异同等重要,而多基因HTG(26.0%)是最常见的单一遗传形式。FCS具有最独特的临床特征(最高TG、最低PRS、最高胰腺炎风险),FD则TG水平最低。研究局限性包括未分析非经典乳糜微粒血症基因(如GPD1、CREB3L3)、样本量较小(特别是FCS组)以及仅包含欧洲血统个体。
**研究结论翻译**:本研究队列中,严重HTG表现出高度异质性的遗传结构。对经典乳糜微粒血症基因的分析鉴定出24.4%的病例。更广泛的遗传方法,包括APOE变异和ε
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2基因型,额外检测出14.6%的非重叠病例以及与乳糜微粒血症变异重叠的4.1%。TG-PRS的评估进一步识别出26.0%的孤立多基因HTG和9.8%的重叠病例,将主要遗传决定因素的总检出率提高至65.0%。剩余35.0%的患者具有中等至低PRS。在遗传定义的HTG组中,FCS具有最独特的临床特征。需要进一步研究以确定升高的TG-PRS是否修饰罕见变异携带者的表型严重程度。