蒙古分离的杆状病毒——欧洲天蚕核多角体病毒新种埃里奥加斯特分离株（ManeNPV-Er）的基因组特征分析

《Virology Journal》：Genomic characterization of a baculovirus isolate, Malacosoma neustria nucleopolyhedrovirus Eriogaster neogena isolate (ManeNPV-Er) from Mongolia

　　

摘要

背景

杆状病毒是一类高度多样化的昆虫特异性DNA病毒，它们与自身的鳞翅目宿主共同进化，通常具有较高的宿主特异性以及地理上的种群结构差异。为探究与宿主相关的遗传差异的基因组基础，我们对从蒙古采集的患有病症的Eriogaster neogena幼虫中分离出的杆状病毒的全基因组进行了测序和分析。

方法

对该分离株——命名为Malacosoma neustria核多角体病毒Eriogaster neogena分离株（ManeNPV-Er）的全基因组进行了测序并进行了比较分析。通过基于lef8/lef9/polh序列的系统发育分析和成对K2P距离分析，来评估其与其它杆状病毒的分类学关系。

结果

比较基因组分析显示，该病毒与从土耳其不同宿主物种（Malacosoma neustria）中分离出的Malacosoma neustria核多角体病毒（ManeNPV-T2）的核苷酸同源性为86.9%。尽管二者分类学关系密切，但如此低的同源性表明存在显著的基因组差异。基于lef8/lef9/polh序列的系统发育分析和成对K2P距离分析则证实了二者属于同一物种。不过，经过校正后的K2P距离值表明二者已经开始出现分化，可能需要更多的基因组和生物学证据来进一步确认。ManeNPV-Er的显著遗传差异很可能是由于适应不同宿主以及在不同地区地理隔离的共同作用所导致的。这类分化模式与杆状病毒及其鳞翅目宿主之间常见的平行多样化现象一致。

结论

总体而言，我们的研究结果拓展了目前对杆状病毒基因组多样性的认识，并为宿主更替与地理隔离如何共同影响病毒物种形成提供了新的见解。