基于转录组学研究慢性鼻窦炎中的关键应力颗粒相关基因

《Scientific Reports》：Exploration of key stress granule-related genes in chronic sinusitis based on transcriptomics

　　

摘要

慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）常常会引发细胞内应激颗粒（SGs）的形成。本研究旨在找出与CRSwNP和SGs相关的关键基因，为改善CRSwNP的治疗和管理提供新的思路。研究从公共数据库中获取了GSE136825、GSE179265以及与SG相关的基因集数据。通过机器学习、ROC分析以及表达验证来确定关键基因。随后，通过构建列线图、基因集富集分析（GSEA）、免疫浸润分析以及药物预测等方法来探究这些基因的调控机制。有三个候选基因——ANG、CRYAB和FBP1——通过了ROC分析和表达验证，最终被确定为关键基因。GSEA分析显示，这些基因共同参与细胞周期通路。免疫浸润分析发现，CRSwNP组与对照组之间存在23种差异性丰富的免疫细胞类型，而ANG、CRYAB和FBP1都与2型T辅助细胞存在显著的正相关关系。此外，雌二醇、硫酸铜和三烯醇胺被确定为能够与这三个关键基因发生相互作用的药物。这些研究结果为推进CRSwNP的诊断提供了宝贵的线索。