人类原代巨噬细胞中ANRIL基因座上的基因型依赖性代谢与炎症调控

《Molecular Genetics and Genomics》：Genotype-dependent metabolic and inflammatory regulation at the ANRIL locus in human primary macrophages

　　

摘要

长非编码RNA ANRIL以及多种单核苷酸多态性被认为与冠状动脉疾病（CAD）的遗传易感性密切相关。然而，这些变异如何影响基因表达目前仍不完全清楚。本研究旨在探讨携带rs1333049、rs10757274和rs564398变异的健康成年男性单核细胞来源的巨噬细胞中，线性和环状ANRIL异构体表达以及部分与CAD和糖尿病相关基因的基因型依赖性差异。首先从具有特定ANRIL基因型的健康男性捐献者中分离出外周血单核细胞，再利用巨噬细胞集落刺激因子将其分化为巨噬细胞。通过流式细胞术和共聚焦成像技术确认单核细胞的身份及其向巨噬细胞的分化情况。随后使用qRT-PCR技术检测CDKN2A、CDKN2B、ABCA1、PRKAA1、PPARGC1A、TNFA、TNFAIP3等基因的表达水平，以及环状和线性ANRIL转录本的表达情况。研究还分析了不同基因型组之间的表达差异及基因型依赖性的关联关系。结果显示，rs10757274/rs1333049的AA/CC基因型与PPARGC1A和ABCA1的表达降低有关，同时表达降低而表达升高。相反，rs10757274/rs1333049携带G等位基因则与CDKN2A和线性ANRIL的表达增加相关。rs564398的CC基因型则与PPARGC1A表达降低以及PRKAA1水平改变有关。相关性分析表明，ANRIL异构体与某些基因之间存在基因型特异性的关联。这些研究结果提示，ANRIL变异会影响巨噬细胞在细胞周期调控、炎症反应、脂质代谢和能量平衡等途径上的基因表达，且这种影响存在基因型差异。尽管这项研究属于探索性研究，但其结果为CAD和糖尿病相关的9p21.3区域变异可能通过此类转录调控机制发挥作用提供了依据。

图形摘要

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