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  • 多功能自驱动开关实现无标记CRISPR/Cas12a传感系统用于microRNA直接检测

    为解决传统CRISPR/Cas12a系统检测microRNA(miRNA)需逆转录、预扩增和荧光标记的技术瓶颈,研究人员开发了集成靶标识别、CRISPR激活、荧光信号传导和自主信号放大的分子开关。该研究实现了对miR-21的无标记检测(LOD=4.8 nM),在准确性、精密度和选择性方面表现优异,为miRNA床旁检测提供了新策略。

    来源:Systematic and Applied Microbiology

    时间:2025-07-17

  • 基于微型DNA核酸酶IscB的枯草芽孢杆菌高效基因组编辑系统开发及应用

    本研究针对枯草芽孢杆菌(B. subtilis) CRISPR-Cas9系统因cas基因过大导致的编辑效率限制,开发了基于微型核酸酶IscB/enIscB的pBsuIscB/pBsuenIscB编辑系统。该系统通过ωRNA引导实现13.3%-100%的基因删除效率,可单次完成169.9 kb大片段删除及多拷贝基因整合,为微生物细胞工厂构建提供了更高效的基因组编辑工具。

    来源:Systematic and Applied Microbiology

    时间:2025-07-17

  • 综述:灵芝酸在食品工业中的生物学功能、合成生物学策略及应用前景

    这篇综述系统阐述了灵芝酸(GAs)的多种生物活性(如抗氧化、抗肿瘤、免疫调节等),深入解析了其甲羟戊酸(MVA)和细胞色素P450(CYP450)依赖的合成途径,并探讨了合成生物学技术(如CRISPR-Cas9基因编辑、酵母异源表达)在提升GAs产量中的应用潜力,为医药、功能食品开发提供了新思路。

    来源:Journal of Future Foods

    时间:2025-07-17

  • 基于IntAC系统的果蝇细胞高分辨率全基因组CRISPR筛选技术揭示细胞适应性基因与毒素抗性机制

    本研究通过开发IntAC(整合酶联合抗CRISPR蛋白)系统,显著提升了果蝇细胞CRISPR筛选的分辨率。研究人员利用强效dU6:3启动子和机器学习优化的sgRNA文库,结合AcrIIA4介导的Cas9活性时空调控,成功构建了迄今最全面的果蝇细胞适应性基因图谱。该技术不仅揭示了GP1锚定合成通路中新型组分CG46311的功能,还在毒素抗性和溶质转运体筛选中展现出卓越的精确性,为无脊椎动物功能基因组学研究提供了通用性解决方案。

    来源:Nature Communications

    时间:2025-07-16

  • FGFR信号通过SOAT1依赖性胆固醇代谢调控促进乳腺癌侵袭:揭示三阴性乳腺癌治疗新靶点

    本研究针对三阴性乳腺癌(TNBC)中FGFR信号通路的促癌机制展开探索。研究人员发现FGFR激活通过上调固醇O-酰基转移酶1(SOAT1)促进胆固醇酯化储存,进而增强肿瘤细胞侵袭能力。通过CRISPR/Cas9基因编辑和特异性抑制剂验证,证实抑制SOAT1可显著减缓肿瘤生长和转移。该研究首次揭示FGFR-SOAT1-胆固醇代谢轴在TNBC进展中的关键作用,为靶向代谢干预提供新策略。

    来源:Breast Cancer Research

    时间:2025-07-16

  • 代谢工程改造大肠杆菌BL21高效生产木糖醇的工艺优化与机制解析

    针对化学法合成木糖醇存在的高能耗、高污染问题,研究人员通过代谢工程改造大肠杆菌BL21(DE3),引入异源木糖还原酶基因xyrB、优化NADPH辅因子供应并敲除竞争途径基因xylA,最终使工程菌在优化发酵条件下木糖醇产量达13.8 g/L(转化率0.92 g/g木糖),为绿色生物制造提供了新策略。

    来源:Biochemical Engineering Journal

    时间:2025-07-16

  • 代谢工程驱动前体积累:通过L-天冬氨酸和L-高丝氨酸通路优化增强O-琥珀酰-L-高丝氨酸的生物合成

    本研究针对O-琥珀酰-L-高丝氨酸(OSH)传统化学合成法效率低下的问题,通过代谢工程技术改造大肠杆菌W3110,优化磷酸烯醇式丙酮酸-丙酮酸-草酰乙酸(PEP-PYR-OAA)通路和L-天冬氨酸代谢途径,构建出高效OSH生产菌株OSH23和OSH24,在5L发酵罐中分别实现131.99g/L的产量和1.18g/L/h的生产效率,为L-蛋氨酸工业化生产奠定基础。

    来源:Biochemical Engineering Journal

    时间:2025-07-16

  • 基于CRISPR-Cas9系统的病毒基因组敲入细胞系快速构建及感染性病毒高效制备新策略

    针对难培养病毒的研究瓶颈,研究人员利用CRISPR-Cas9系统在AAVS1安全港位点构建了携带HBV(A/B/C/D型)和HEV全基因组的Huh7稳定细胞系。该体系经多西环素诱导可高效表达病毒基因组和蛋白,产生的病毒颗粒具有感染性且可被中和抗体阻断。该技术为病毒学研究、抗病毒药物筛选及疫苗研发提供了通用型平台。

    来源:Journal of Virological Methods

    时间:2025-07-16

  • 基于RAA-CRISPR/Cas12a双模式系统的鲤春病毒血症病毒(SVCV)便携式一体化检测技术开发与应用

    为解决鲤春病毒血症病毒(SVCV)现场检测难题,上海海洋大学团队开发了集成重组酶辅助扩增(RAA)、CRISPR/Cas12a和侧流层析试纸(LFD)的双模式检测系统。该研究通过优化crRNA探针与蔗糖双相反应体系,实现37℃条件下90分钟内完成检测,灵敏度达6.04×100 copies/μL,临床样本验证显示与传统PCR 100%吻合,为水产疫病防控提供了突破性现场解决方案。

    来源:Aquaculture Reports

    时间:2025-07-16

  • 基于GRN对齐参数优化的可解释基因扰动响应建模:GPO-VAE方法

    本研究针对基因扰动响应预测中模型可解释性不足的问题,提出GPO-VAE(GRN-aligned Parameter Optimization VAE),通过将基因调控网络(GRN)拓扑结构融入变分自编码器(VAE)的潜空间设计,实现了扰动效应的生物学机制解释。该模型在K562、RPE1等细胞系数据集上达到SOTA预测性能(ATE-p 0.658),同时构建的GRN网络成功捕获KRAS、MYC等癌症相关通路,为靶向治疗开发提供新思路。

    来源:Bioinformatics

    时间:2025-07-16

  • 综述:基于CRISPR的遗传性血液疾病治疗性基因组编辑

    这篇综述系统阐述了CRISPR-Cas9、碱基编辑器(BEs)和先导编辑器(PEs)在遗传性血液疾病治疗中的突破性进展。重点分析了造血干细胞(HSCs)体外编辑技术(如首个FDA批准的exa-cel疗法)面临的挑战,包括复杂的体外操作、清髓性预处理条件,以及HSCs静默特性带来的靶向难题,为下一代基因治疗提供了技术路线图。

    来源:Nature Reviews Drug Discovery

    时间:2025-07-16

  • 果蝇Adar蛋白通过调控R-loop稳态维持基因组完整性的非编辑依赖性机制研究

    本研究揭示了果蝇Adar蛋白在维持基因组稳定性中的新机制。研究人员通过CRISPR/Cas9技术构建Adar基因敲除模型,结合全基因组ssDRIP-seq等技术,发现Adar缺失导致R-loop异常积累和DNA损伤。值得注意的是,缺乏A-to-I编辑活性的Adar突变体仍能维持基因组稳定,表明Adar通过编辑非依赖性方式调控R-loop稳态。该研究为理解ADAR家族蛋白功能拓展了新视角,对基因组不稳定相关疾病机制研究具有重要意义。

    来源:BMC Biology

    时间:2025-07-16

  • 人类基因组中顺式调控模块靶基因预测及功能类型解析揭示其独特特性

    本研究针对顺式调控模块(CRM)靶基因预测难题,开发了CAPP方法,通过整合染色质可及性(CA)、RNA-seq和Hi-C数据,成功预测了14.3%的人类基因组CRM靶基因,首次系统揭示了双重功能CRM(dual CRMs)的远距离调控偏好、增强子(enhancer)的协同作用特性以及沉默子(silencer)对广谱表达基因的调控倾向,为解析基因调控网络提供了新工具。

    来源:BMC Biology

    时间:2025-07-16

  • 综述:CRISPR Cas专利档案第三部分:Prime Editing与整合酶变体技术

    这篇综述聚焦基因编辑领域新兴的专利争议,深入剖析Prime Editing(PE)及其整合酶变体(如PASSIGE/PASTE)的技术原理与应用挑战。作者Ulrich Storz通过专利数据库分析指出,尽管这些技术能实现大片段DNA精准整合(如镰状细胞病治疗),但复杂的知识产权格局将影响行业自由操作(FTO)[1]。文章对比了CRISPR-Cas9/Cas12a的HDR/NHEJ机制,特别强调pegRNA设计(含spacer/scaffold/RT模板)在PE系统中的核心作用。

    来源:Journal of Biotechnology

    时间:2025-07-16

  • PAXX/Ku相互作用稳定性决定需末端加工的双链DNA断裂修复速率

    本研究揭示了PAXX蛋白K193R突变通过稳定与Ku70/80的DNA非依赖性结合,显著加速需末端加工的双链断裂(DSB)的经典非同源末端连接(c-NHEJ)修复进程,首次证明NHEJ复合体稳定性是DSB修复的限速步骤,为DNA修复工程提供了新靶点。

    来源:Journal of Biological Chemistry

    时间:2025-07-16

  • 果蝇发育过程中组蛋白H3K27去甲基化酶Utx的时空动态调控机制及其表观遗传稳定性研究

    本研究通过CRISPR/Cas9基因编辑和G-TRACE系统,首次揭示果蝇唯一H3K27去甲基化酶Utx的调控元件在胚胎期高活性而在幼虫翅/眼/腿组织中失活,但蛋白持续稳定表达;发现JmjC结构域完整性(非催化活性)决定Utx蛋白稳定性,并揭示核质定位调控机制,为Kabuki综合征和癌症中UTX突变机制提供新见解。

    来源:Insect Biochemistry and Molecular Biology

    时间:2025-07-16

  • 基于CRISPR/Cas12a与熵驱动放大的高灵敏度单细胞电化学发光生物传感器

    为解决单细胞检测中灵敏度不足和操作复杂的问题,研究人员开发了一种整合CRISPR/Cas12a与熵驱动放大的均相电化学发光(ECL)生物传感器,实现了对HEK293细胞中hERG钾通道的单分子级检测,信号无需平均即可识别,为肿瘤研究和分子诊断提供了新工具。

    来源:Bioelectrochemistry

    时间:2025-07-16

  • 基于滚环扩增与CRISPR/Cas14a纳米酶电化学检测鼻咽癌外泌体miRNA-205的超灵敏生物传感器

    针对鼻咽癌(NPC)早期诊断中miRNA-205(miR-205)低丰度检测难题,研究人员开发了整合PtNWs/MXene纳米酶、滚环扩增(RCA)和CRISPR/Cas14a的电化学生物传感器。该技术通过"一对多"信号放大实现4.6 aM检测限,可区分单碱基错配,临床验证与qRT-PCR结果一致,为肿瘤早期诊断提供新平台。

    来源:Bioelectrochemistry

    时间:2025-07-16

  • 综述:工程化益生菌在治疗应用中的最新进展

    这篇综述系统阐述了工程化益生菌(engineered probiotics)在肿瘤、炎症性肠病(IBD)、代谢性疾病和感染性疾病中的治疗机制与应用进展,重点介绍了其作为递送载体(如分泌细胞因子/纳米抗体)、代谢助手(如降解苯丙氨酸Phe)、肠道微环境调节剂(如分泌短链脂肪酸SCFAs)及肿瘤靶向治疗平台(如响应缺氧微环境)的多功能策略,并探讨了合成生物学工具(如CRISPR-Cas)的赋能潜力与临床转化挑战。

    来源:BioDesign Research

    时间:2025-07-16

  • 禾本科作物CEPR1功能解析:肽激素识别机制与大麦生长发育调控

    本研究针对CEPR1受体在单子叶与双子叶植物中的功能保守性问题,通过拟南芥互补实验和CRISPR-Cas9基因编辑技术,首次证实大麦、水稻和玉米CEPR1同源基因能恢复拟南芥cepr1突变体的根构型、营养发育和繁殖缺陷,并揭示大麦cepr1突变体呈现更陡峭的初生根角度和40%的产量损失。该发现为通过CEPR1调控谷物根系构型以提高养分利用效率提供了新靶点。

    来源:Journal of Experimental Botany

    时间:2025-07-16


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