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  • 综述:抗限制蛋白的结构、功能及应用前景

    这篇综述系统阐述了抗限制蛋白(如ArdA和ArdB)在克服原核生物限制修饰(RM)系统中的作用。DNA模拟蛋白ArdA通过特异性模仿DNA序列靶向RM系统,而小分子ArdA(sArdA)的发现拓展了其应用潜力;ArdB则作为广谱抑制剂可阻断I型RM系统和CRISPR/Cas3活性,为提升难转化菌株的遗传操作效率提供新策略。

    来源:Russian Journal of Genetics

    时间:2025-09-10

  • 猪肠道微生物组中原噬菌体的多样性挖掘与功能特征解析

    这篇综述系统研究了猪肠道微生物组中原噬菌体(prophage)的分布特征与功能机制。通过分析7,524个原核基因组,鉴定出10,742个原噬菌体,揭示其通过CRISPR间隔序列整合(CRISPR spacer integration)参与宿主防御系统调控,并携带辅助代谢基因(AMGs)、抗生素抗性基因(ARGs)和毒力因子(VFs)等关键功能模块。研究为理解哺乳动物肠道中噬菌体-宿主互作提供了新视角。

    来源:Frontiers in Microbiology

    时间:2025-09-10

  • DNA适配体调控引导编辑(PE2)效率的筛选与表征及其在膀胱癌p53功能修复中的应用

    这篇研究通过SELEX筛选获得Cas9特异性ssDNA适配体,经分子对接证实其与PE2蛋白(含Cas9 nickase和逆转录酶)结合后,能显著提升引导编辑效率(流式细胞术显示EGFP编辑效率提升至40.5%)。在膀胱癌细胞中,适配体-PE2复合物成功修复p53突变(qPCR显示mRNA表达提升3.32倍),抑制细胞增殖并促进凋亡(CCK-8和Annexin V/PI实验验证),为精准基因治疗提供新策略。

    来源:Frontiers in Molecular Biosciences

    时间:2025-09-10

  • 综述:基因编辑与基因组学技术在开发气候适应性豆科作物中的革命性进展与前景

    这篇综述系统探讨了如何整合CRISPR等基因组编辑技术、数量性状位点(QTL)定位、全基因组关联分析(GWAS)及机器学习等计算生物学方法,突破豆科作物抗逆育种的瓶颈。文章强调从地方品种和野生近缘种中挖掘抗性等位基因,通过多组学联用策略培育高产、耐病虫害且适应非生物胁迫的豆科新品种,为应对气候变化下的粮食安全挑战提供创新解决方案。

    来源:Plant Molecular Biology

    时间:2025-09-10

  • CRISPR/Cas9脱靶效应通过八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因敲除诱导甘蔗白化现象及其对生物燃料研究的启示

    为解决甘蔗木质素生物合成对生物燃料生产的限制,研究人员利用CRISPR/Cas9系统靶向肉桂醇脱氢酶(CAD)基因进行编辑。意外发现设计的gRNA与八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因存在部分同源,导致90%转化植株出现白化表型。该研究揭示了gRNA精确设计对避免脱靶效应的重要性,为甘蔗遗传改良提供了重要技术参考。

    来源:Sugar Tech

    时间:2025-09-10

  • 儿童癌症基因组学与遗传易感性研究进展:从分子诊断到精准治疗

    这篇综述系统阐述了儿童癌症基因组学(NGS)与遗传易感性研究的最新进展,涵盖DNA/RNA测序技术(RNA-seq)、功能基因组学(CRISPR编辑)和液体活检等前沿方法在诊断、预后和靶向治疗中的应用,特别强调了基因融合(gene fusion)、表观遗传驱动因子和复杂结构变异(CGRs)的临床价值,为儿童癌症的精准医疗提供了重要理论依据。

    来源:Annual Review of Genomics and Human Genetics

    时间:2025-09-09

  • 人类合成生物学与可编程基因调控控制:多层级工具开发与治疗应用新进展

    这篇综述系统梳理了人类合成生物学领域的最新进展,重点阐述了DNA、RNA和蛋白质水平的可编程基因调控工具开发(如CRISPR-Cas9、synTFs、RBPs和PROTACs),及其在构建合成基因回路和疾病治疗中的应用。文章通过高通量筛选技术(MPRAs、STARR-seq)揭示了模块化调控元件的设计原则,并展望了多层级工具联用对精准医疗的推动作用。

    来源:Annual Review of Genomics and Human Genetics

    时间:2025-09-09

  • 综述:CRISPR激活技术在植物抗病育种中新型基因的鉴定与应用

    这篇综述系统阐述了CRISPR激活(CRISPRa)技术如何通过精准上调内源基因表达来增强植物抗病性,重点探讨了其与功能基因组学(GWAS、多组学)的协同应用、可编程转录激活因子(PTAs)的优化策略,以及实现非转基因过表达的潜力,为作物抗病育种提供了创新范式。

    来源:Frontiers in Genome Editing

    时间:2025-09-09

  • 植物细菌病害中的易感基因:从分子机制到抗病育种应用

    这篇综述系统阐述了植物易感基因(S genes)在细菌病害中的关键作用,包括其被病原菌效应因子(如TALEs)利用的分子机制、功能多样性(如SWEET糖转运蛋白家族、转录因子等),以及通过基因编辑(CRISPR-Cas)、表观遗传调控和天然等位基因挖掘实现抗病育种的应用前景。文章强调了S基因研究对理解植物-病原互作界面和开发持久抗性策略的双重意义。

    来源:Annual Review of Phytopathology

    时间:2025-09-09

  • 小麦抗病性挑战与全球策略:从基因编辑到精准表型平台的可持续解决方案

    这篇综述系统阐述了小麦抗病育种面临的病原菌进化、杀菌剂抗性及品种更替等核心挑战,提出了整合多基因抗性(APR)、基因组选择(GS)和CRISPR-Cas9基因编辑等全球策略,强调通过精准表型平台(PPP)和移动病原诊断系统(MARPLE)实现抗病品种的快速部署,为保障全球小麦安全提供科学路径。

    来源:Annual Review of Phytopathology

    时间:2025-09-09

  • 基于PafA介导邻近标记的APPLE-MS技术:高灵敏度解析弱相互作用及膜蛋白互作网络的新方法

    针对传统亲和纯化-质谱(AP-MS)在检测弱/瞬时相互作用及膜蛋白互作(PPI)的局限性,Luo等开发了结合Twin-Strep标签富集与PafA介导邻近标记的APPLE-MS技术。该方法灵敏度提升4.07倍,成功揭示SARS-CoV-2 ORF9B动态互作组和PIN1内源性互作网络,为病毒-宿主互作研究和药物靶点发现提供新工具。

    来源:Cell Reports Methods

    时间:2025-09-09

  • 金黄色葡萄球菌中可编程无选择压力CRISPRi系统的开发及其在宿主长期互作研究中的应用

    本研究针对传统CRISPR干扰(CRISPRi)系统在细菌基因功能研究中依赖抗生素选择和诱导剂的局限性,开发了一种基于pCM29质粒的可编程无选择压力CRISPRi(ppsf-CRISPRi)系统。该系统利用金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)内源启动子调控dCas9表达,通过靶向沉默凝固酶(coa)和自溶素(atl)基因,在无需外源诱导和抗生素压力下实现≥27代的稳定基因沉默。研究证实该系统在体外血浆凝固实验、THP-1巨噬细胞感染和蜡螟(Galleria mellonella)感染模型中均能有效模拟基因敲除表型,为长期宿主-病原体互作研究提供了新工具。

    来源:iScience

    时间:2025-09-09

  • CRISPR/Cas9编辑大豆赤霉素受体基因GmGID1-2显著提升产量与共生固氮效率

    本研究通过CRISPR/Cas9技术敲除大豆赤霉素受体基因GmGID1-2,创制了具有半矮化、茎秆粗壮、分枝增多等优良农艺性状的新种质。该突变体通过调控DELLA蛋白积累,同步实现了产量提升17.16%、籽粒含油量增加1.64%以及根瘤固氮能力增强20.96%的突破性进展,为豆科作物可持续育种提供了关键靶点。

    来源:Journal of Integrative Plant Biology

    时间:2025-09-09

  • 葫芦科作物致病尖孢镰刀菌中ECC1效应蛋白同源基因调控宿主特异性毒力的分子机制

    这篇研究揭示了尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum, Fo)中ECC1效应蛋白家族通过基因复制和功能分化调控宿主特异性的新机制。通过CRISPR/Cas9基因编辑和表达谱分析,发现ECC1aFom和ECC1b分别促进甜瓜和黄瓜感染,而ECC1aFom在黄瓜中触发非寄主抗性(avr基因功能)。结构预测显示ECC1具有ToxA-like效应蛋白特征,其早期感染阶段表达峰值(4 dpi)暗示其在宿主定殖中的关键作用。该研究为理解病原菌宿主适应性进化提供了分子靶点。

    来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    时间:2025-09-09

  • 呼吸道微病毒科噬菌体遗传多样性揭示人体呼吸生态系统病毒组学新维度

    本研究通过宏基因组测序从健康人群鼻咽拭子中鉴定出327个微病毒科(Microviridae)相关重叠群,包括15个近完整基因组,首次系统揭示了该科噬菌体在呼吸道的遗传多样性。研究采用VP1(主要衣壳蛋白)系统发育分析将基因组划分为7个新群,CRISPR间隔序列预测宿主为普雷沃菌(Prevotella)等。这些基因组(5,000-6,484 nt)与已知微病毒科成员VP1相似性<46.73%,提示可能存在新属,为呼吸道疾病干预提供新靶点。

    来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    时间:2025-09-09

  • CRISPRi与Tn-seq联合解析艰难梭菌必需基因谱:抗生素靶点发现与细胞分裂机制新见解

    这篇研究通过CRISPR干扰(CRISPRi)和转座子插入测序(Tn-seq)技术,系统鉴定了艰难梭菌(Clostridioides difficile)R20291菌株的346个必需基因,其中283个与既往研究重叠形成"核心必需基因组"。研究验证了>90%靶基因的必需性,发现80%基因敲低导致形态异常,并首次鉴定18个定位于分裂位点的新蛋白(如YlmG/YlxW/YlxX),为开发窄谱抗生素和解析该病原体独特分裂机制提供了关键靶点与工具。

    来源:Journal of Bacteriology

    时间:2025-09-09

  • 啤酒腐败菌Megasphaera paucivorans基因组破译:揭示其胁迫耐受机制与啤酒工业防控新靶点

    来自日本Asahi Quality and Innovations的研究团队针对啤酒腐败菌Megasphaera paucivorans展开基因组测序研究,解析了其酸/乙醇胁迫耐受基因(如L-乳酸脱氢酶、HorA/HitA转运蛋白)和CRISPR阵列等防御机制,为啤酒工业生物污染防控提供分子靶点。

    来源:Microbiology Resource Announcements

    时间:2025-09-09

  • DNMT3A缺失通过降低DNMT3B基因甲基化导致HEK293细胞全基因组转录改变

    来自研究人员的最新研究揭示了DNMT3A在表观遗传调控中的关键作用。通过CRISPR/Cas9技术构建DNMT3A缺陷型HEK293细胞,发现其全基因组DNA甲基化水平降低21.5%,导致细胞增殖受损及MAPK/PI3K-Akt通路阻滞。RNA-seq分析显示代谢相关基因上调而核糖体功能基因下调,并首次发现DNMT3A缺失会降低DNMT3B基因甲基化水平。该研究为理解DNA甲基化调控网络提供了新见解。

    来源:Current Genomics

    时间:2025-09-09

  • 综述:从生长到生存:Aux/IAA基因在植物发育与逆境调控中的作用

    这篇综述系统阐述了植物激素(auxin)信号通路核心元件Aux/IAA基因家族的分子机制与生物学功能,重点解析了其通过抑制ARFs(auxin response factors)调控基因转录的"分子开关"作用,以及在根系构型、器官发生和环境胁迫响应中的多维度调控网络,为作物抗逆育种提供了理论靶点。

    来源:Plant Science

    时间:2025-09-09

  • 综述:番茄(Solanum lycopersicum)中基于CRISPR-Cas系统的基因组编辑研究现状

    这篇综述系统阐述了CRISPR-Cas9技术在番茄育种中的应用进展,重点介绍了该技术在果实品质改良(如色泽调控基因PSY1/MYB12/SGR1)、抗逆性提升(如抗病基因SlWRKY52/SlMYC1)及生长发育调控(如雄性不育基因SlMS10/SlACO2)等方面的突破性成果。文章详细解析了CRISPR-Cas系统(包括II/V/VI型)的分子机制、多重编辑策略(如Csy4/tRNA介导的多靶点编辑)及无转基因株系培育方法,为番茄精准育种提供了重要技术参考。

    来源:Plant Breeding

    时间:2025-09-09


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