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突破PAM限制:一种基于粘性末端介导的CRISPR/Cas12a与RPA耦合的通用双链DNA检测方法及其在KRAS G12C单碱基突变检测中的应用
本研究开发了一种通用PAM-free的CRISPR/Cas12a检测平台,通过整合粘性末端介导的CRISPR/Cas12a与重组酶扩增(RPA),利用NlaIII酶切实现扩增产物精准切割,形成标准粘性末端,显著提升Cas12a活性。该方法灵敏度达40 aM,成功检测0.1%频发的KRAS G12C突变,与FastNGS结果一致,并实现单管检测策略,简化流程并降低气溶胶污染。
来源:Analytical Chemistry
时间:2025-11-12
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ORF19.7608(PPP1)的生物学特性研究:这是一种由白色念珠菌(Candida albicans)产生的、与生物膜形成相关的基因
Candida albicans生物膜形成中ORF19.4654、ORF19.7608和PBR1三个基因的分子机制及功能研究。通过CRISPR-Cas9构建突变体和荧光蛋白融合体,发现ORF19.7608编码的Ppp1在生物膜条件下形成独特的细胞膜 punctate分布模式,但基因敲除不影响生物膜结构、生物质积累及抗逆性。Pbr1和ORF19.4654主要定位于细胞 vacuole。共定位分析表明Ppp1与eisosome标记蛋白Sur7无直接关联。该研究揭示了C. albicans生物膜调控中特定基因的非必需功能及蛋白亚细胞分布特征。
来源:PLOS One
时间:2025-11-12
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基于VQR、VRER和EQR变体的CRISPR-Cas9系统扩展PAM(广泛匹配)兼容性的设计规则
PAM识别机制研究表明,CRISPR-Cas9变体VQR/VRER/EQR的非标准PAM结合依赖直接接触与远程网络协同作用,D1135 V/E置换通过K1107和S1109稳定DNA结合,而单纯R→Q替换破坏结合裂隙和REC3动态,影响效率。摘要分隔符:
来源:The Journal of Physical Chemistry B
时间:2025-11-12
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综述:猪角膜组织与人畜共患病风险:当前证据的综述
角膜浑浊影响全球数百万患者,传统器官移植供体不足。猪角膜异种移植因解剖生理相似性成为替代方案,CRISPR/Cas技术通过基因编辑降低免疫排斥和病原体风险。潜在病原体如猪内源性逆转录病毒(PERV)、猪巨细胞病毒(PCMV)等,但无活体传播证据。监管机构如WHO和IXA已制定指南,韩国和中国已启动临床试验,生物安全措施有效减少微生物污染。该技术风险低于其他器官异种移植,未来研究将验证长期安全性和有效性。
来源:Xenotransplantation
时间:2025-11-11
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基于结构的CRISPR/Cas9蛋白分类:一种用于阐明Cas9别构效应的机器学习方法
本研究采用结构基机器学习系统识别CRISPR/Cas9的长程调理性网络,筛选出28对关键Lys-Arg残基对,揭示其介导的“电负性山谷”对SpCas9稳定性和特异性的调控机制,并通过分子动力学验证其作用路径,为理性设计高保真Cas9变体提供新框架。
来源:Journal of Molecular Biology
时间:2025-11-11
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HIGD2通过改善线粒体功能赋予水稻耐缺氧胁迫的能力
水稻OsHIGD2基因通过维持线粒体呼吸复合体IV活性及细胞膜完整性,增强植株缺氧适应能力。过表达OsHIGD2的转基因水稻在7天缺氧处理后恢复期叶数、长度及面积分别提升2-3倍,而敲除突变体则出现生长迟滞和膜透性增加。免疫印迹证实OsHIGD2蛋白在过表达株系中显著积累,且线粒体复合体IV活性在过表达株中提升2倍,突变体降低30%。研究显示OsHIGD2介导的缺氧适应机制主要依赖线粒体功能维持而非糖酵解途径调整,为抗洪水稻育种提供新靶点。
来源:Plant Physiology and Biochemistry
时间:2025-11-11
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CRISPR/Cas9介导的基因组编辑研究发现,10个在睾丸中表达丰富的基因以及1个在睾丸中表达不丰富的基因对小鼠的繁殖能力并非必需
本研究通过CRISPR/Cas9技术敲除11个候选基因(10个睾丸富集基因及1个非富集基因),评估其对小鼠精子生成及生育能力的影响。结果显示,所有基因敲除小鼠均保持正常生育能力及精子形态与运动功能,提示这些基因可能并非精子生成必需。分隔符
来源:Andrology
时间:2025-11-11
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综述:SOX9:一种在免疫系统中具有双重功能的新型调节因子,及其作为治疗靶点的潜力
SOX9作为转录因子在肿瘤免疫逃逸中通过抑制T/NK细胞功能、促进M2巨噬细胞极化及调控免疫检查点分子发挥关键作用,而在炎症和修复过程中则通过维持巨噬细胞功能促进组织再生,呈现双功能特性,为癌症治疗和免疫相关疾病提供了新靶点。
来源:Frontiers in Molecular Biosciences
时间:2025-11-11
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全基因组鉴定与功能分析揭示了四种调控苹果(Malus domestica)对瓦萨溃疡病(Valsa canker)抗性的长链重复序列-类逆转录聚合酶(LRR-RLPs)
苹果LRR-RLP基因抗Valsa mali病害机制研究:通过基因组筛选鉴定58个LRR-RLP,功能验证发现MdRLP7、21、34、50增强抗性但非VmE02受体,揭示其可能识别其他PAMP或效应子。
来源:Horticultural Plant Journal
时间:2025-11-11
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CRISPR/Cas12b介导的一管式活细胞检测方法有助于在禽肉中检测沙门氏菌(Salmonella Typhimurium)
CRISPR/Cas12b结合酶切重组扩增(ERA)的一管式快速检测方法,通过PMA预处理抑制死菌DNA干扰,37℃扩增结合60℃Cas12b活化的温度分区设计,实现沙门氏菌Typhimurium的高灵敏度检测(1pg/μL DNA,1.43×10² CFU/mL鸡肉,1×10² CFU/mL鸭肉),适用于食品样本现场筛查。
来源:Food Bioscience
时间:2025-11-11
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Kluyvera ascorbata的CRISPR-cas系统:来自基因组数据的见解
Kluyvera属作为机会致病菌及耐药基因载体受到关注,研究通过基因组挖掘分析13种Kluyvera的CRISPR-Cas系统,发现仅K. ascorbata具有完整型I-E系统及多簇阵列,spacer序列揭示与噬菌体/质粒的互作历史,系统发育树显示其与沙门氏菌等Enterobacteriaceae亲缘关系近,首次构建该属CRISPR-Cas架构图谱,为诊断技术革新提供依据。
来源:Current Genetics
时间:2025-11-11
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基于地图的克隆技术及功能验证:研究ClChlH基因对西瓜(Citrullus lanatus)果皮黄色的调控作用
水melon黄皮表型由单一显性基因ClYR控制,该基因位于染色体4的325.37 Kb区间,包含ClChlH基因的启动子区InDels变异,导致转录抑制和黄皮表型。CRISPR验证显示ClChlH功能突变与黄-绿皮及叶色嵌合表达相关。摘要结束分隔符:
来源:Theoretical and Applied Genetics
时间:2025-11-11
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利用基因组学技术提升努格遗传资源以促进可持续油料生产
本刊推荐:为解决努格(Guizotia abyssinica L.)因自交不亲和性(self-incompatibility)、落粒性、病虫害等因素导致的产量瓶颈,研究人员系统综述了该作物从传统育种到基因组工具应用的研究进展。研究通过开发自交亲和系(self-compatible lines)、转录组测序(RNA-seq)和连锁作图(linkage mapping)等技术,提出了整合基因组学、表型组学和参与式育种(participatory breeding)的协同策略,为加速培育高产、抗逆努格品种提供了理论框架,对保障埃塞俄比亚粮食安全与小农户生计具有重要意义。
来源:Plant Genetic Resources
时间:2025-11-11
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一种集成HCR和CRISPR-Cas12a技术的双信号放大生物传感器,用于精准量化FEN1的活性
FEN1检测方法融合HCR与CRISPR-Cas12a trans-cleavage,实现超灵敏(LOD 1.6×10⁻³ U/mL)线性检测(2×10⁻³-5.0 U/mL),简化操作流程,支持癌细胞与正常细胞样本区分及抑制剂筛选。
来源:Microchemical Journal
时间:2025-11-11
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基于香豆素的光敏固态载体有助于非色谱法纯化RNA寡核苷酸
基于邻苯二甲酰亚胺的可见光光解锚固剂合成及其在RNA寡核苷酸非色谱纯化中的应用。该锚固剂通过456 nm可见光光解实现RNA固相合成产物的选择性释放,特别适用于含硫代磷酸骨架的RNA,避免紫外线导致的RNA结构损伤。优化后流程成功纯化20-nt至103-nt长链RNA,包括sgRNA,其功能经CRISPR-Cas9实验验证与常规纯化方法相当,且纯度达86.2%-97.4%。
来源:The Journal of Organic Chemistry
时间:2025-11-11
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CTRL利用CRISPR-Cas7–11实现基因特异性RNA调控
精准基因表达调控新工具CTRL基于CRISPR-Cas7–11效应器开发,可特异性靶向合成mRNA并实现高效、可调的基因表达抑制,适用于多模型系统研究。
来源:ACS Synthetic Biology
时间:2025-11-10
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综述:用于原核生物和真核生物的高通量、多重化和自动化基因组编辑的分子方法
基因组编辑技术综述:探讨Recombineering、CRISPR/Cas9系统、Base编辑及转座酶在原核和真核生物中的应用,强调自动化实验室平台(如生物工厂)通过整合分子工具、微流体技术和AI驱动流程实现大规模并行编辑,推动合成生物学发展。
来源:Current Opinion in Biotechnology
时间:2025-11-10
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黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)中异源二聚体NAC蛋白的生殖系特异性亚基在发育过程中的时空切换
果蝇germline特异性NAC复合体通过α/β亚基动态组装与泛在NAC形成杂交复合物调控生殖细胞发育的蛋白质稳态,并依赖磷酸化修饰和内在无序区域(IDR)的结构特性实现时空特异性功能。
来源:Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research
时间:2025-11-10
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通过CRISPR/Cas12a介导的多基因编辑技术培育低过敏性和低抗营养因子的大豆
本研究利用CRISPR/Cas12a系统创制出低过敏原和低抗营养因子的大豆品种,显著降低P34、KTI及LE含量和活性,小鼠实验证实可有效缓解过敏反应,为食品生产、动物饲料及免疫治疗提供新资源。
来源:Journal of Agricultural and Food Chemistry
时间:2025-11-10
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在棉铃虫(Helicoverpa armigera)的雄性和雌性触角中,一种高度表达的费洛蒙受体能够特异性识别植物挥发物
棉铃虫HarmOR11受体介导植物挥发物感知,CRISPR-Cas9敲除导致雄性触角对苯乙酸盐、苯甲酸酯等三种物质不敏感,雌性相应感器数量减少且产卵偏好降低,揭示该受体在性信息素调控中的关键作用,为优化诱捕器提供新靶点。
来源:Journal of Agricultural and Food Chemistry
时间:2025-11-10