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靶向长链非编码RNA MEG3以调节内质网应激和自噬:一种基于CRISPR/Cas9的策略,在急性肾损伤(AKI)向慢性肾病(CKD)转变过程中发挥作用
MEG3通过调控内质网应激与自噬平衡驱动AKI-CKD转化,CRISPR/Cas9敲除MEG3联合TUDCA可协同抑制ER应激并减少纤维化标志物。
来源:Evolving Earth
时间:2025-11-22
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基于基因组语言模型的功能性从头基因的语义设计
该研究展示了基因组语言模型Evo通过语义设计生成具有功能的蛋白质和RNA的能力,包括新型抗毒蛋白和抗CRISPR蛋白,并构建了包含120亿碱基对的SynGenome数据库,验证了其抑制Cas9和CRISPR效应的有效性,突破了传统序列设计的局限。
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CRISPR代谢工程双效提升镰刀菌蛋白营养与可持续性
本研究针对传统真菌蛋白营养效价低、底物转化率不足及环境负担较重等问题,通过CRISPR/Cas9介导的无疤痕基因敲除技术对Fusarium venenatum进行代谢工程改造。研究成功构建了FCPD工程菌株,其必需氨基酸指数(EAAI)提升32.9%,底物消耗降低44.3%,蛋白质转化率提高至野生型的2.24倍。基于工业规模数据的生命周期评估(LCA)显示,在六国生产情景下FCPD可降低全球变暖潜能(GWP)4-61.3%,且环境表现优于细胞培养肉与鸡肉。该工作为基因编辑技术同步提升替代蛋白营养价值与环境可持续性提供了实证。
来源:TRENDS IN Biotechnology
时间:2025-11-21
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Cas12a辅助的split crRNA复合物(CASCADE):一种用于多样化实体分析检测的通用型平台
本研究针对Cas12a系统在非核酸靶标检测中的应用瓶颈,系统探索了Cas12a-split crRNA系统的关键激活参数并建立了设计准则。研究人员开发了名为CASCADE的检测平台,成功实现了对microRNA(如let-7d)、抗生素(如妥布霉素)和蛋白质(如TetR)的高灵敏度、高特异性检测。该平台通过整合侧向层析检测(LFA)增强了便携性,为POCT诊断和环境监测提供了新策略。
来源:Nucleic Acids Research
时间:2025-11-21
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工程化染色质阅读器MCPH1-BRCT实时追踪活细胞和动物体内DNA损伤动力学
本研究针对活体DNA损伤动态监测工具缺乏的难题,开发了基于MCPH1串联BRCT结构域的工程化染色质阅读器(eCR)。该探针可特异性识别DNA双链断裂标志物γH2AX,实现活细胞/动物体内损伤动力学的实时可视化,为DNA修复研究及临床诊断提供新型工具。
来源:Nature Communications
时间:2025-11-21
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使用BreakTag对基因组编辑核酸酶活性进行多级表征
CRISPR可编程核酸酶及向导RNA的多维度分析技术,包含非靶向位点提名、酶活性评估及切割模式解析,支持Cas变体工程优化。采用Cas9向导RNA递送切割基因组DNA,富集平齐/阶梯状双链断裂,结合NGS测序与BreakInspectoR数据分析平台,实现高效高通量表征。配套工具XGScission机器学习模型可预测未知序列切割偏好,HiPlex技术实现千级sgRNA并行制备。全流程仅需3天完成,包含6小时文库构建、测序及分析。
来源:Nature Protocols
时间:2025-11-21
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内在的NPRL2和NPRL3蛋白调控B细胞恶性肿瘤对CAR-T细胞治疗的敏感性
通过CRISPR/Cas9基因组筛查发现NPRL2/NPRL3抑制mTORC1信号通路,导致肿瘤细胞与CAR-T细胞结合减少、激活障碍及 exhaustion增加,从而抵抗CAR-T细胞毒性。基因敲除或激活mTORC1可逆转此现象,体内实验证实靶向该通路可增强CAR-T疗效。分隔符:
来源:Journal of Genetics and Genomics
时间:2025-11-21
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综述:将CRISPR-dCas系统有效转移到多种微生物中的策略
CRISPR-dCas工具在微生物基因功能研究中应用广泛但需优化,本文系统梳理其在不同微生物中的迭代发展,分析载体设计、靶标识别等常见障碍及解决方案,并提出模块化改造、宿主适配性增强等策略以提升工具普适性。
来源:ACS Synthetic Biology
时间:2025-11-21
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连接纤毛、应激反应与蛋白质稳态异常:RPGRIP1视网膜类器官的变异评估与治疗策略新视角
本研究针对RPGRIP1相关遗传性视网膜疾病(IRD)中近半数变异为临床意义未明(VUS)的难题,利用患者来源及CRISPR-Cas9基因编辑的iPSC视网膜类器官模型,系统揭示了RPGRIP1变异通过破坏连接纤毛(CC)互作组、引发应激反应与蛋白质稳态异常导致光感受器功能障碍。研究首次证实错义VUS c.2108T>C p.(Ile703Thr)的致病性,并通过AAV介导的基因增强疗法成功挽救疾病表型,为VUS重分类及基因治疗评估提供了新型生物标志物体系。
来源:Stem Cell Reports
时间:2025-11-21
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综述:MAP激酶与气孔调控:最新研究进展与未来展望
MAPK信号通路整合ABA、温度、光照等多重信号调控气孔发育、运动及免疫,物种间存在适应性差异。新兴工具如AI驱动的激酶预测、单细胞组学及CRISPR技术为调控MAPK通路、培育抗逆作物提供新途径。
来源:TRENDS IN Plant Science
时间:2025-11-21
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水稻稻瘟病病原体的效应蛋白AvrPib通过靶向Raf样蛋白激酶OsMAPKKK72来抑制MAPK信号通路,从而破坏植物的抗病性
水稻稻瘟病菌效应蛋白AvrPib通过靶向OsMAPKKK72抑制MAPK信号通路,导致水稻抗稻瘟病能力下降。OsMAPKKK72作为支架蛋白增强OsMKK9与OsMPK3/6的相互作用,进而激活MAPK介导的免疫应答。该研究揭示了OsMAPKKK72在水稻基础抗性中的作用机制,并阐明了AvrPib干扰MAPK信号传导的分子路径。
来源:Journal of Integrative Plant Biology
时间:2025-11-21
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METTL3介导m6A修饰调控小鼠胚胎干细胞中转座子与2C样程序诱导的作用机制研究
本研究针对METTL3缺失对小鼠胚胎干细胞中转座子(TEs)和2C样基因表达调控机制不明确的问题,通过构建Mettl3基因敲除(KO)模型,结合多组学分析和胚胎嵌合实验,发现METTL3通过m6A酶活性依赖性方式广泛抑制TEs和2C样基因表达,且该作用不依赖培养条件。更重要的是,研究首次通过dTAG瞬时降解系统证明METTL3缺陷的mESCs可贡献于滋养层谱系,揭示了m6A缺失促进2C样程序转变的新机制,为理解表观遗传调控在细胞命运决定中的作用提供了重要依据。
来源:Cell Regeneration
时间:2025-11-21
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综述:油菜遗传改良的简要历程:从传统育种到基因组编辑
油麦通过持续遗传和生物技术应用,从工业用油转型为全球重要食用油。1970年代双低品种(低芥酸、低硫苷)突破奠定食用安全基础,后续引入杂交品种、基因编辑(如CRISPR/Cas9)显著提升产量和抗逆性。油质改良方面,通过FAD2/FAD3基因编辑实现高油酸、零芥酸,并开发高月桂酸、富Omega-3特种油。抗病性方面,整合黑腐病、白粉病等抗性基因,利用基因编辑增强抗逆机制。未来需克服多倍体基因组复杂性,结合多组学、AI加速育种创新。
来源:Physiologia Plantarum
时间:2025-11-21
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掌握控制Leptinotarsa decemlineata性发育的基因开关
性别决定与分化在 Colorado potato beetle 中的分子机制研究。通过构建蛋白互作网络,鉴定出 Sxl、tra2、dsx 和 fru 四个关键基因,利用 RNAi 和 CRISPR/Cas9 技术发现 dsx 和 tra2 调节性别分化:dsx 敲除导致雄性雌性化,影响生殖腺发育;tra2 敲除影响 dsx 剪接,导致雌性雄性化,并降低繁殖力。研究揭示了昆虫性别决定系统中的保守与分化机制。
来源:Insect Biochemistry and Molecular Biology
时间:2025-11-21
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基于QTL定位和组学分析的卷心菜裂头抗性候选基因研究
光合作用效率提升是提高作物产量和品质的关键,本研究通过EMS诱变筛选获得西瓜黄绿表型突变体PKH352,发现其由Clygp基因编码的信号识别粒子54kDa蛋白突变引起,并通过CRISPR/Cas9介导的基因编辑验证了该基因功能,转录组分析显示该突变显著影响叶绿体发育和光合相关基因表达。
来源:Journal of Insect Physiology
时间:2025-11-21
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利用eVLP介导的Cas9递送技术预防胰岛移植中的免疫排斥反应(IBMIR)
胰岛移植中即时血液介导的炎症反应(IBMIR)导致移植失败,本研究利用 engineered virus-like particles (eVLP)-mediated CRISPR/Cas9系统敲除 rat islets 中的 TF 和 PAI-1 基因,有效抑制 IBMIR,使移植胰岛存活率显著提高,血糖控制改善,且未发现明显脱靶效应。
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可靶向基因组CRISPR筛选揭示KEAP1/NRF2轴调控PD-L1表达的新机制
本研究通过靶向“可靶向基因组”的CRISPR筛选,在胰腺癌和卵巢癌细胞中发现KEAP1/NRF2轴是IFNγ诱导PD-L1表达的关键调控通路。KEAP1缺失或抑制剂激活NRF2可转录抑制PD-L1,增强抗肿瘤免疫。该研究为免疫检查点调控提供了新靶点,对改善免疫治疗耐药性具有重要意义。
来源:Communications Biology
时间:2025-11-21
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整合转录组学和磷酸蛋白质组学分析揭示了水稻中SnRK1信号网络的关键组成部分
水稻SnRK1信号网络功能解析:通过CRISPR/Cas9构建snrk1突变体,结合表型、转录组、蛋白质组和磷酸蛋白质组分析,揭示SnRK1在能量充足与饥饿条件下调控生长、代谢及抗病性的双重作用,并鉴定亚功能分化及新型磷酸化靶点。
来源:Plant Direct
时间:2025-11-21
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基于MOF载体信号探针和CRISPR/Cas12a切割技术的电化学生物传感平台,用于微小RNA的灵敏检测
该研究开发了一种基于DNA门控MOF、DSN辅助信号放大及CRISPR/Cas12a系统的电化学生物传感平台,通过控制甲基蓝释放实现miRNA的高灵敏检测,成功应用于非小细胞肺癌标志物let-7a的早期诊断。
来源:Analytical Chemistry
时间:2025-11-21
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一种基于微流控芯片的电化学生物传感器,与CRISPR/Cas12a结合使用,用于同时检测食源性病原体
微流控电化学传感器实现65分钟内同步检测金黄色葡萄球菌和大肠杆菌,通过整合RPA扩增和CRISPR/Cas12a识别,利用ssDNA探针信号与电流变化关联,检测限达3 CFU/mL,适用于食品现场快速检测。
来源:Analytical Chemistry
时间:2025-11-21